Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGC8

CHST3, Carbohydrate sulfotransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST3Q7LGC8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHST3Q7LGC8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHST3Q7LGC8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHST3Q7LGC8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHST3Q7LGC8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CHST3Q7LGC8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CHST3Q7LGC8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CHST3Q7LGC8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHST3Q7LGC8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHST3Q7LGC8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHST3Q7LGC8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHST3Q7LGC8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHST3Q7LGC8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHST3Q7LGC8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHST3Q7LGC8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHST3Q7LGC8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHST3Q7LGC8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CHST3Q7LGC8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CHST3Q7LGC8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CHST3Q7LGC8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CHST3Q7LGC8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CHST3Q7LGC8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CHST3Q7LGC8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHST3Q7LGC8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHST3Q7LGC8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHST3Q7LGC8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHST3Q7LGC8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHST3Q7LGC8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHST3Q7LGC8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHST3Q7LGC8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHST3Q7LGC8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CHST3Q7LGC8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHST3Q7LGC8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHST3Q7LGC8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHST3Q7LGC8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHST3Q7LGC8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHST3Q7LGC8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHST3Q7LGC8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHST3Q7LGC8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHST3Q7LGC8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHST3Q7LGC8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHST3Q7LGC8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHST3Q7LGC8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHST3Q7LGC8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHST3Q7LGC8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHST3Q7LGC8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CHST3Q7LGC8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHST3Q7LGC8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHST3Q7LGC8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHST3Q7LGC8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHST3Q7LGC8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHST3Q7LGC8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHST3Q7LGC8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHST3Q7LGC8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHST3Q7LGC8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHST3Q7LGC8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHST3Q7LGC8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHST3Q7LGC8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CHST3Q7LGC8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHST3Q7LGC8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHST3Q7LGC8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHST3Q7LGC8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHST3Q7LGC8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHST3Q7LGC8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHST3Q7LGC8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHST3Q7LGC8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CHST3Q7LGC8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHST3Q7LGC8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHST3Q7LGC8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHST3Q7LGC8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHST3Q7LGC8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHST3Q7LGC8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHST3Q7LGC8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHST3Q7LGC8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHST3Q7LGC8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHST3Q7LGC8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHST3Q7LGC8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHST3Q7LGC8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHST3Q7LGC8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHST3Q7LGC8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHST3Q7LGC8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHST3Q7LGC8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHST3Q7LGC8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHST3Q7LGC8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHST3Q7LGC8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHST3Q7LGC8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHST3Q7LGC8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHST3Q7LGC8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CHST3Q7LGC8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHST3Q7LGC8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHST3Q7LGC8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHST3Q7LGC8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHST3Q7LGC8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHST3Q7LGC8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHST3Q7LGC8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHST3Q7LGC8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHST3Q7LGC8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHST3Q7LGC8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHST3Q7LGC8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHST3Q7LGC8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms