Protein–RNA interactions for Protein: Q71UM5

RPS27L, 40S ribosomal protein S27-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS27LQ71UM5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS27LQ71UM5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS27LQ71UM5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS27LQ71UM5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS27LQ71UM5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS27LQ71UM5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS27LQ71UM5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS27LQ71UM5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS27LQ71UM5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS27LQ71UM5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS27LQ71UM5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS27LQ71UM5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS27LQ71UM5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS27LQ71UM5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RPS27LQ71UM5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RPS27LQ71UM5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS27LQ71UM5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS27LQ71UM5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS27LQ71UM5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS27LQ71UM5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS27LQ71UM5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS27LQ71UM5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS27LQ71UM5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS27LQ71UM5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS27LQ71UM5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS27LQ71UM5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS27LQ71UM5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS27LQ71UM5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS27LQ71UM5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS27LQ71UM5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS27LQ71UM5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS27LQ71UM5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS27LQ71UM5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS27LQ71UM5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS27LQ71UM5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS27LQ71UM5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS27LQ71UM5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS27LQ71UM5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS27LQ71UM5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS27LQ71UM5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS27LQ71UM5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS27LQ71UM5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS27LQ71UM5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS27LQ71UM5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS27LQ71UM5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS27LQ71UM5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS27LQ71UM5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS27LQ71UM5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS27LQ71UM5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS27LQ71UM5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS27LQ71UM5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS27LQ71UM5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS27LQ71UM5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS27LQ71UM5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS27LQ71UM5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS27LQ71UM5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPS27LQ71UM5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPS27LQ71UM5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPS27LQ71UM5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS27LQ71UM5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS27LQ71UM5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS27LQ71UM5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS27LQ71UM5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS27LQ71UM5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS27LQ71UM5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS27LQ71UM5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS27LQ71UM5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS27LQ71UM5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS27LQ71UM5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS27LQ71UM5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS27LQ71UM5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS27LQ71UM5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS27LQ71UM5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS27LQ71UM5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS27LQ71UM5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS27LQ71UM5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS27LQ71UM5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS27LQ71UM5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS27LQ71UM5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS27LQ71UM5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS27LQ71UM5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS27LQ71UM5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS27LQ71UM5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS27LQ71UM5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS27LQ71UM5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS27LQ71UM5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS27LQ71UM5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS27LQ71UM5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS27LQ71UM5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS27LQ71UM5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS27LQ71UM5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS27LQ71UM5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS27LQ71UM5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS27LQ71UM5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS27LQ71UM5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS27LQ71UM5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS27LQ71UM5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS27LQ71UM5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS27LQ71UM5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS27LQ71UM5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms