Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP43Q70EL4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP43Q70EL4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP43Q70EL4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
USP43Q70EL4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
USP43Q70EL4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
USP43Q70EL4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP43Q70EL4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP43Q70EL4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP43Q70EL4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP43Q70EL4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP43Q70EL4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP43Q70EL4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP43Q70EL4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP43Q70EL4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP43Q70EL4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP43Q70EL4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP43Q70EL4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP43Q70EL4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP43Q70EL4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP43Q70EL4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP43Q70EL4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP43Q70EL4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
USP43Q70EL4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP43Q70EL4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
USP43Q70EL4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP43Q70EL4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP43Q70EL4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP43Q70EL4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP43Q70EL4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP43Q70EL4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP43Q70EL4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP43Q70EL4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP43Q70EL4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP43Q70EL4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP43Q70EL4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
USP43Q70EL4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
USP43Q70EL4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
USP43Q70EL4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
USP43Q70EL4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
USP43Q70EL4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
USP43Q70EL4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
USP43Q70EL4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
USP43Q70EL4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
USP43Q70EL4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
USP43Q70EL4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
USP43Q70EL4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
USP43Q70EL4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
USP43Q70EL4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
USP43Q70EL4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
USP43Q70EL4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
USP43Q70EL4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
USP43Q70EL4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
USP43Q70EL4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
USP43Q70EL4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
USP43Q70EL4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
USP43Q70EL4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
USP43Q70EL4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
USP43Q70EL4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
USP43Q70EL4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP43Q70EL4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP43Q70EL4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP43Q70EL4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP43Q70EL4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP43Q70EL4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP43Q70EL4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP43Q70EL4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP43Q70EL4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP43Q70EL4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP43Q70EL4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP43Q70EL4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP43Q70EL4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP43Q70EL4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP43Q70EL4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP43Q70EL4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP43Q70EL4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP43Q70EL4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP43Q70EL4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP43Q70EL4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP43Q70EL4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP43Q70EL4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP43Q70EL4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP43Q70EL4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP43Q70EL4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP43Q70EL4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP43Q70EL4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP43Q70EL4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP43Q70EL4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP43Q70EL4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP43Q70EL4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP43Q70EL4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP43Q70EL4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP43Q70EL4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP43Q70EL4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP43Q70EL4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP43Q70EL4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP43Q70EL4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP43Q70EL4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP43Q70EL4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP43Q70EL4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms