Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVL6

KIAA1549L, UPF0606 protein KIAA1549L, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549LQ6ZVL6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KIAA1549LQ6ZVL6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KIAA1549LQ6ZVL6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KIAA1549LQ6ZVL6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KIAA1549LQ6ZVL6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KIAA1549LQ6ZVL6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KIAA1549LQ6ZVL6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KIAA1549LQ6ZVL6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KIAA1549LQ6ZVL6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KIAA1549LQ6ZVL6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KIAA1549LQ6ZVL6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KIAA1549LQ6ZVL6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KIAA1549LQ6ZVL6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KIAA1549LQ6ZVL6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KIAA1549LQ6ZVL6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KIAA1549LQ6ZVL6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KIAA1549LQ6ZVL6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KIAA1549LQ6ZVL6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KIAA1549LQ6ZVL6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KIAA1549LQ6ZVL6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
KIAA1549LQ6ZVL6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KIAA1549LQ6ZVL6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KIAA1549LQ6ZVL6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KIAA1549LQ6ZVL6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KIAA1549LQ6ZVL6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KIAA1549LQ6ZVL6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KIAA1549LQ6ZVL6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KIAA1549LQ6ZVL6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KIAA1549LQ6ZVL6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KIAA1549LQ6ZVL6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KIAA1549LQ6ZVL6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
KIAA1549LQ6ZVL6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KIAA1549LQ6ZVL6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KIAA1549LQ6ZVL6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
KIAA1549LQ6ZVL6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KIAA1549LQ6ZVL6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KIAA1549LQ6ZVL6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KIAA1549LQ6ZVL6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KIAA1549LQ6ZVL6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KIAA1549LQ6ZVL6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KIAA1549LQ6ZVL6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KIAA1549LQ6ZVL6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KIAA1549LQ6ZVL6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KIAA1549LQ6ZVL6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KIAA1549LQ6ZVL6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KIAA1549LQ6ZVL6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KIAA1549LQ6ZVL6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KIAA1549LQ6ZVL6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KIAA1549LQ6ZVL6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KIAA1549LQ6ZVL6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KIAA1549LQ6ZVL6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KIAA1549LQ6ZVL6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KIAA1549LQ6ZVL6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KIAA1549LQ6ZVL6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KIAA1549LQ6ZVL6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KIAA1549LQ6ZVL6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KIAA1549LQ6ZVL6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KIAA1549LQ6ZVL6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KIAA1549LQ6ZVL6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KIAA1549LQ6ZVL6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KIAA1549LQ6ZVL6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KIAA1549LQ6ZVL6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KIAA1549LQ6ZVL6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KIAA1549LQ6ZVL6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KIAA1549LQ6ZVL6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
KIAA1549LQ6ZVL6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KIAA1549LQ6ZVL6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KIAA1549LQ6ZVL6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KIAA1549LQ6ZVL6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KIAA1549LQ6ZVL6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KIAA1549LQ6ZVL6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KIAA1549LQ6ZVL6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KIAA1549LQ6ZVL6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KIAA1549LQ6ZVL6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KIAA1549LQ6ZVL6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KIAA1549LQ6ZVL6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KIAA1549LQ6ZVL6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KIAA1549LQ6ZVL6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KIAA1549LQ6ZVL6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KIAA1549LQ6ZVL6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KIAA1549LQ6ZVL6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KIAA1549LQ6ZVL6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KIAA1549LQ6ZVL6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KIAA1549LQ6ZVL6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KIAA1549LQ6ZVL6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KIAA1549LQ6ZVL6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KIAA1549LQ6ZVL6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KIAA1549LQ6ZVL6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KIAA1549LQ6ZVL6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KIAA1549LQ6ZVL6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KIAA1549LQ6ZVL6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KIAA1549LQ6ZVL6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KIAA1549LQ6ZVL6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KIAA1549LQ6ZVL6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KIAA1549LQ6ZVL6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KIAA1549LQ6ZVL6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KIAA1549LQ6ZVL6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KIAA1549LQ6ZVL6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms