Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTQ4

CDHR3, Cadherin-related family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR3Q6ZTQ4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDHR3Q6ZTQ4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDHR3Q6ZTQ4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDHR3Q6ZTQ4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDHR3Q6ZTQ4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDHR3Q6ZTQ4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDHR3Q6ZTQ4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDHR3Q6ZTQ4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDHR3Q6ZTQ4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDHR3Q6ZTQ4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDHR3Q6ZTQ4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDHR3Q6ZTQ4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDHR3Q6ZTQ4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDHR3Q6ZTQ4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDHR3Q6ZTQ4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDHR3Q6ZTQ4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDHR3Q6ZTQ4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDHR3Q6ZTQ4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDHR3Q6ZTQ4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDHR3Q6ZTQ4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDHR3Q6ZTQ4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDHR3Q6ZTQ4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDHR3Q6ZTQ4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDHR3Q6ZTQ4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDHR3Q6ZTQ4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDHR3Q6ZTQ4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDHR3Q6ZTQ4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDHR3Q6ZTQ4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDHR3Q6ZTQ4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDHR3Q6ZTQ4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDHR3Q6ZTQ4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDHR3Q6ZTQ4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDHR3Q6ZTQ4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDHR3Q6ZTQ4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDHR3Q6ZTQ4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CDHR3Q6ZTQ4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDHR3Q6ZTQ4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDHR3Q6ZTQ4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDHR3Q6ZTQ4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDHR3Q6ZTQ4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDHR3Q6ZTQ4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDHR3Q6ZTQ4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDHR3Q6ZTQ4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDHR3Q6ZTQ4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDHR3Q6ZTQ4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDHR3Q6ZTQ4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CDHR3Q6ZTQ4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDHR3Q6ZTQ4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDHR3Q6ZTQ4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDHR3Q6ZTQ4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDHR3Q6ZTQ4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDHR3Q6ZTQ4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDHR3Q6ZTQ4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDHR3Q6ZTQ4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDHR3Q6ZTQ4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDHR3Q6ZTQ4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDHR3Q6ZTQ4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDHR3Q6ZTQ4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDHR3Q6ZTQ4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDHR3Q6ZTQ4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDHR3Q6ZTQ4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDHR3Q6ZTQ4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDHR3Q6ZTQ4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CDHR3Q6ZTQ4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CDHR3Q6ZTQ4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDHR3Q6ZTQ4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDHR3Q6ZTQ4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDHR3Q6ZTQ4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDHR3Q6ZTQ4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDHR3Q6ZTQ4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDHR3Q6ZTQ4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDHR3Q6ZTQ4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDHR3Q6ZTQ4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDHR3Q6ZTQ4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CDHR3Q6ZTQ4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDHR3Q6ZTQ4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDHR3Q6ZTQ4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDHR3Q6ZTQ4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDHR3Q6ZTQ4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CDHR3Q6ZTQ4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDHR3Q6ZTQ4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDHR3Q6ZTQ4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CDHR3Q6ZTQ4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDHR3Q6ZTQ4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDHR3Q6ZTQ4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDHR3Q6ZTQ4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDHR3Q6ZTQ4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDHR3Q6ZTQ4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDHR3Q6ZTQ4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDHR3Q6ZTQ4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDHR3Q6ZTQ4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDHR3Q6ZTQ4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDHR3Q6ZTQ4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDHR3Q6ZTQ4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDHR3Q6ZTQ4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDHR3Q6ZTQ4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDHR3Q6ZTQ4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDHR3Q6ZTQ4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDHR3Q6ZTQ4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDHR3Q6ZTQ4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms