Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM43BQ6ZT52 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM43BQ6ZT52 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM43BQ6ZT52 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM43BQ6ZT52 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM43BQ6ZT52 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM43BQ6ZT52 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM43BQ6ZT52 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM43BQ6ZT52 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM43BQ6ZT52 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM43BQ6ZT52 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM43BQ6ZT52 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM43BQ6ZT52 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM43BQ6ZT52 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM43BQ6ZT52 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM43BQ6ZT52 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM43BQ6ZT52 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM43BQ6ZT52 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM43BQ6ZT52 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM43BQ6ZT52 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM43BQ6ZT52 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM43BQ6ZT52 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM43BQ6ZT52 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM43BQ6ZT52 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM43BQ6ZT52 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM43BQ6ZT52 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM43BQ6ZT52 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM43BQ6ZT52 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM43BQ6ZT52 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM43BQ6ZT52 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM43BQ6ZT52 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM43BQ6ZT52 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM43BQ6ZT52 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM43BQ6ZT52 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM43BQ6ZT52 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM43BQ6ZT52 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM43BQ6ZT52 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM43BQ6ZT52 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM43BQ6ZT52 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM43BQ6ZT52 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM43BQ6ZT52 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM43BQ6ZT52 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM43BQ6ZT52 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM43BQ6ZT52 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM43BQ6ZT52 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM43BQ6ZT52 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM43BQ6ZT52 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM43BQ6ZT52 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM43BQ6ZT52 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM43BQ6ZT52 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM43BQ6ZT52 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM43BQ6ZT52 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM43BQ6ZT52 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM43BQ6ZT52 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM43BQ6ZT52 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM43BQ6ZT52 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM43BQ6ZT52 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM43BQ6ZT52 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM43BQ6ZT52 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM43BQ6ZT52 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM43BQ6ZT52 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM43BQ6ZT52 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM43BQ6ZT52 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM43BQ6ZT52 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM43BQ6ZT52 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FAM43BQ6ZT52 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM43BQ6ZT52 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM43BQ6ZT52 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM43BQ6ZT52 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM43BQ6ZT52 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM43BQ6ZT52 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM43BQ6ZT52 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM43BQ6ZT52 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM43BQ6ZT52 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
FAM43BQ6ZT52 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
FAM43BQ6ZT52 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
FAM43BQ6ZT52 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FAM43BQ6ZT52 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
FAM43BQ6ZT52 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM43BQ6ZT52 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM43BQ6ZT52 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM43BQ6ZT52 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM43BQ6ZT52 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM43BQ6ZT52 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM43BQ6ZT52 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM43BQ6ZT52 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM43BQ6ZT52 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM43BQ6ZT52 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM43BQ6ZT52 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM43BQ6ZT52 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM43BQ6ZT52 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM43BQ6ZT52 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM43BQ6ZT52 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM43BQ6ZT52 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM43BQ6ZT52 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM43BQ6ZT52 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM43BQ6ZT52 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM43BQ6ZT52 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM43BQ6ZT52 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM43BQ6ZT52 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
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