Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR62

RTL4, Retrotransposon Gag-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL4Q6ZR62 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RTL4Q6ZR62 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTL4Q6ZR62 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RTL4Q6ZR62 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTL4Q6ZR62 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTL4Q6ZR62 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTL4Q6ZR62 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTL4Q6ZR62 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTL4Q6ZR62 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTL4Q6ZR62 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTL4Q6ZR62 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTL4Q6ZR62 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTL4Q6ZR62 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTL4Q6ZR62 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RTL4Q6ZR62 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RTL4Q6ZR62 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTL4Q6ZR62 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTL4Q6ZR62 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTL4Q6ZR62 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTL4Q6ZR62 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTL4Q6ZR62 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTL4Q6ZR62 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTL4Q6ZR62 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTL4Q6ZR62 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTL4Q6ZR62 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTL4Q6ZR62 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTL4Q6ZR62 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTL4Q6ZR62 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTL4Q6ZR62 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RTL4Q6ZR62 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTL4Q6ZR62 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTL4Q6ZR62 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTL4Q6ZR62 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTL4Q6ZR62 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTL4Q6ZR62 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTL4Q6ZR62 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTL4Q6ZR62 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTL4Q6ZR62 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTL4Q6ZR62 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTL4Q6ZR62 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTL4Q6ZR62 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTL4Q6ZR62 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTL4Q6ZR62 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RTL4Q6ZR62 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RTL4Q6ZR62 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTL4Q6ZR62 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTL4Q6ZR62 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTL4Q6ZR62 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTL4Q6ZR62 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTL4Q6ZR62 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTL4Q6ZR62 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTL4Q6ZR62 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTL4Q6ZR62 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTL4Q6ZR62 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTL4Q6ZR62 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTL4Q6ZR62 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTL4Q6ZR62 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTL4Q6ZR62 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTL4Q6ZR62 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTL4Q6ZR62 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTL4Q6ZR62 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTL4Q6ZR62 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RTL4Q6ZR62 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTL4Q6ZR62 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RTL4Q6ZR62 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RTL4Q6ZR62 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTL4Q6ZR62 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTL4Q6ZR62 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTL4Q6ZR62 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTL4Q6ZR62 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RTL4Q6ZR62 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTL4Q6ZR62 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTL4Q6ZR62 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTL4Q6ZR62 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTL4Q6ZR62 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTL4Q6ZR62 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTL4Q6ZR62 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTL4Q6ZR62 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTL4Q6ZR62 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTL4Q6ZR62 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTL4Q6ZR62 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTL4Q6ZR62 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTL4Q6ZR62 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTL4Q6ZR62 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTL4Q6ZR62 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTL4Q6ZR62 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTL4Q6ZR62 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTL4Q6ZR62 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTL4Q6ZR62 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RTL4Q6ZR62 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTL4Q6ZR62 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTL4Q6ZR62 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTL4Q6ZR62 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTL4Q6ZR62 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTL4Q6ZR62 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTL4Q6ZR62 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTL4Q6ZR62 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTL4Q6ZR62 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTL4Q6ZR62 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTL4Q6ZR62 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms