Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VSTM1Q6UX27 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VSTM1Q6UX27 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VSTM1Q6UX27 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VSTM1Q6UX27 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VSTM1Q6UX27 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VSTM1Q6UX27 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VSTM1Q6UX27 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VSTM1Q6UX27 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VSTM1Q6UX27 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VSTM1Q6UX27 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VSTM1Q6UX27 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VSTM1Q6UX27 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VSTM1Q6UX27 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VSTM1Q6UX27 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VSTM1Q6UX27 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VSTM1Q6UX27 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VSTM1Q6UX27 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VSTM1Q6UX27 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
VSTM1Q6UX27 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
VSTM1Q6UX27 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VSTM1Q6UX27 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VSTM1Q6UX27 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VSTM1Q6UX27 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VSTM1Q6UX27 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VSTM1Q6UX27 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VSTM1Q6UX27 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VSTM1Q6UX27 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VSTM1Q6UX27 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VSTM1Q6UX27 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VSTM1Q6UX27 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VSTM1Q6UX27 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VSTM1Q6UX27 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VSTM1Q6UX27 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
VSTM1Q6UX27 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VSTM1Q6UX27 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VSTM1Q6UX27 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
VSTM1Q6UX27 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
VSTM1Q6UX27 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VSTM1Q6UX27 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VSTM1Q6UX27 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VSTM1Q6UX27 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VSTM1Q6UX27 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VSTM1Q6UX27 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VSTM1Q6UX27 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VSTM1Q6UX27 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VSTM1Q6UX27 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VSTM1Q6UX27 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VSTM1Q6UX27 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VSTM1Q6UX27 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VSTM1Q6UX27 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VSTM1Q6UX27 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VSTM1Q6UX27 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VSTM1Q6UX27 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VSTM1Q6UX27 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
VSTM1Q6UX27 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VSTM1Q6UX27 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VSTM1Q6UX27 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VSTM1Q6UX27 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VSTM1Q6UX27 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VSTM1Q6UX27 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VSTM1Q6UX27 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VSTM1Q6UX27 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VSTM1Q6UX27 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VSTM1Q6UX27 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VSTM1Q6UX27 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VSTM1Q6UX27 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VSTM1Q6UX27 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VSTM1Q6UX27 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VSTM1Q6UX27 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VSTM1Q6UX27 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VSTM1Q6UX27 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VSTM1Q6UX27 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VSTM1Q6UX27 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VSTM1Q6UX27 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VSTM1Q6UX27 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VSTM1Q6UX27 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VSTM1Q6UX27 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VSTM1Q6UX27 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VSTM1Q6UX27 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VSTM1Q6UX27 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VSTM1Q6UX27 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VSTM1Q6UX27 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
VSTM1Q6UX27 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VSTM1Q6UX27 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VSTM1Q6UX27 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
VSTM1Q6UX27 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VSTM1Q6UX27 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VSTM1Q6UX27 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VSTM1Q6UX27 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VSTM1Q6UX27 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
VSTM1Q6UX27 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
VSTM1Q6UX27 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
VSTM1Q6UX27 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VSTM1Q6UX27 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VSTM1Q6UX27 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VSTM1Q6UX27 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VSTM1Q6UX27 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VSTM1Q6UX27 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VSTM1Q6UX27 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms