Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNY0

BLOC1S3, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLOC1S3Q6QNY0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BLOC1S3Q6QNY0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BLOC1S3Q6QNY0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BLOC1S3Q6QNY0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BLOC1S3Q6QNY0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BLOC1S3Q6QNY0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BLOC1S3Q6QNY0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BLOC1S3Q6QNY0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BLOC1S3Q6QNY0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BLOC1S3Q6QNY0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BLOC1S3Q6QNY0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BLOC1S3Q6QNY0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BLOC1S3Q6QNY0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BLOC1S3Q6QNY0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BLOC1S3Q6QNY0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BLOC1S3Q6QNY0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BLOC1S3Q6QNY0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BLOC1S3Q6QNY0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BLOC1S3Q6QNY0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BLOC1S3Q6QNY0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BLOC1S3Q6QNY0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BLOC1S3Q6QNY0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BLOC1S3Q6QNY0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BLOC1S3Q6QNY0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BLOC1S3Q6QNY0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BLOC1S3Q6QNY0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BLOC1S3Q6QNY0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BLOC1S3Q6QNY0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BLOC1S3Q6QNY0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BLOC1S3Q6QNY0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BLOC1S3Q6QNY0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BLOC1S3Q6QNY0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BLOC1S3Q6QNY0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BLOC1S3Q6QNY0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BLOC1S3Q6QNY0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BLOC1S3Q6QNY0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BLOC1S3Q6QNY0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BLOC1S3Q6QNY0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BLOC1S3Q6QNY0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BLOC1S3Q6QNY0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BLOC1S3Q6QNY0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BLOC1S3Q6QNY0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BLOC1S3Q6QNY0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BLOC1S3Q6QNY0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BLOC1S3Q6QNY0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BLOC1S3Q6QNY0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BLOC1S3Q6QNY0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BLOC1S3Q6QNY0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BLOC1S3Q6QNY0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BLOC1S3Q6QNY0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BLOC1S3Q6QNY0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BLOC1S3Q6QNY0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BLOC1S3Q6QNY0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BLOC1S3Q6QNY0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BLOC1S3Q6QNY0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BLOC1S3Q6QNY0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BLOC1S3Q6QNY0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BLOC1S3Q6QNY0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BLOC1S3Q6QNY0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BLOC1S3Q6QNY0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BLOC1S3Q6QNY0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BLOC1S3Q6QNY0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BLOC1S3Q6QNY0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BLOC1S3Q6QNY0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BLOC1S3Q6QNY0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BLOC1S3Q6QNY0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BLOC1S3Q6QNY0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BLOC1S3Q6QNY0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BLOC1S3Q6QNY0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BLOC1S3Q6QNY0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BLOC1S3Q6QNY0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BLOC1S3Q6QNY0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BLOC1S3Q6QNY0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BLOC1S3Q6QNY0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BLOC1S3Q6QNY0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BLOC1S3Q6QNY0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BLOC1S3Q6QNY0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BLOC1S3Q6QNY0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BLOC1S3Q6QNY0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BLOC1S3Q6QNY0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BLOC1S3Q6QNY0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BLOC1S3Q6QNY0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BLOC1S3Q6QNY0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BLOC1S3Q6QNY0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BLOC1S3Q6QNY0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BLOC1S3Q6QNY0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BLOC1S3Q6QNY0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BLOC1S3Q6QNY0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BLOC1S3Q6QNY0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BLOC1S3Q6QNY0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BLOC1S3Q6QNY0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BLOC1S3Q6QNY0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BLOC1S3Q6QNY0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BLOC1S3Q6QNY0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BLOC1S3Q6QNY0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BLOC1S3Q6QNY0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BLOC1S3Q6QNY0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BLOC1S3Q6QNY0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BLOC1S3Q6QNY0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BLOC1S3Q6QNY0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms