Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4A7

SFXN4, Sideroflexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN4Q6P4A7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SFXN4Q6P4A7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFXN4Q6P4A7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFXN4Q6P4A7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFXN4Q6P4A7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFXN4Q6P4A7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFXN4Q6P4A7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFXN4Q6P4A7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFXN4Q6P4A7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFXN4Q6P4A7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFXN4Q6P4A7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFXN4Q6P4A7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFXN4Q6P4A7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFXN4Q6P4A7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFXN4Q6P4A7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFXN4Q6P4A7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFXN4Q6P4A7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFXN4Q6P4A7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFXN4Q6P4A7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFXN4Q6P4A7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFXN4Q6P4A7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFXN4Q6P4A7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFXN4Q6P4A7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFXN4Q6P4A7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFXN4Q6P4A7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFXN4Q6P4A7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFXN4Q6P4A7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SFXN4Q6P4A7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFXN4Q6P4A7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFXN4Q6P4A7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFXN4Q6P4A7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFXN4Q6P4A7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFXN4Q6P4A7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFXN4Q6P4A7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFXN4Q6P4A7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFXN4Q6P4A7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFXN4Q6P4A7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFXN4Q6P4A7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFXN4Q6P4A7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFXN4Q6P4A7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFXN4Q6P4A7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFXN4Q6P4A7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFXN4Q6P4A7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFXN4Q6P4A7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFXN4Q6P4A7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFXN4Q6P4A7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFXN4Q6P4A7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFXN4Q6P4A7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFXN4Q6P4A7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFXN4Q6P4A7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFXN4Q6P4A7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFXN4Q6P4A7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFXN4Q6P4A7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFXN4Q6P4A7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFXN4Q6P4A7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFXN4Q6P4A7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFXN4Q6P4A7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFXN4Q6P4A7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFXN4Q6P4A7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFXN4Q6P4A7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFXN4Q6P4A7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFXN4Q6P4A7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFXN4Q6P4A7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFXN4Q6P4A7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFXN4Q6P4A7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFXN4Q6P4A7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFXN4Q6P4A7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFXN4Q6P4A7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFXN4Q6P4A7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SFXN4Q6P4A7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFXN4Q6P4A7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFXN4Q6P4A7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFXN4Q6P4A7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFXN4Q6P4A7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFXN4Q6P4A7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFXN4Q6P4A7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFXN4Q6P4A7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFXN4Q6P4A7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFXN4Q6P4A7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFXN4Q6P4A7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFXN4Q6P4A7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFXN4Q6P4A7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SFXN4Q6P4A7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFXN4Q6P4A7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFXN4Q6P4A7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFXN4Q6P4A7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFXN4Q6P4A7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFXN4Q6P4A7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFXN4Q6P4A7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFXN4Q6P4A7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFXN4Q6P4A7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFXN4Q6P4A7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFXN4Q6P4A7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFXN4Q6P4A7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SFXN4Q6P4A7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFXN4Q6P4A7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFXN4Q6P4A7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFXN4Q6P4A7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFXN4Q6P4A7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SFXN4Q6P4A7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms