Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H3F3CQ6NXT2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H3F3CQ6NXT2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H3F3CQ6NXT2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H3F3CQ6NXT2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
H3F3CQ6NXT2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H3F3CQ6NXT2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H3F3CQ6NXT2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H3F3CQ6NXT2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
H3F3CQ6NXT2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
H3F3CQ6NXT2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H3F3CQ6NXT2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H3F3CQ6NXT2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H3F3CQ6NXT2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H3F3CQ6NXT2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
H3F3CQ6NXT2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H3F3CQ6NXT2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H3F3CQ6NXT2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H3F3CQ6NXT2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H3F3CQ6NXT2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H3F3CQ6NXT2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H3F3CQ6NXT2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H3F3CQ6NXT2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H3F3CQ6NXT2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H3F3CQ6NXT2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H3F3CQ6NXT2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H3F3CQ6NXT2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H3F3CQ6NXT2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H3F3CQ6NXT2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H3F3CQ6NXT2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H3F3CQ6NXT2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
H3F3CQ6NXT2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H3F3CQ6NXT2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H3F3CQ6NXT2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H3F3CQ6NXT2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H3F3CQ6NXT2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H3F3CQ6NXT2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H3F3CQ6NXT2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H3F3CQ6NXT2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H3F3CQ6NXT2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H3F3CQ6NXT2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
H3F3CQ6NXT2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H3F3CQ6NXT2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H3F3CQ6NXT2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H3F3CQ6NXT2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H3F3CQ6NXT2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H3F3CQ6NXT2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H3F3CQ6NXT2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H3F3CQ6NXT2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H3F3CQ6NXT2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H3F3CQ6NXT2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H3F3CQ6NXT2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
H3F3CQ6NXT2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H3F3CQ6NXT2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H3F3CQ6NXT2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H3F3CQ6NXT2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H3F3CQ6NXT2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
H3F3CQ6NXT2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H3F3CQ6NXT2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
H3F3CQ6NXT2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H3F3CQ6NXT2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H3F3CQ6NXT2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H3F3CQ6NXT2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H3F3CQ6NXT2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3F3CQ6NXT2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3F3CQ6NXT2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3F3CQ6NXT2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3F3CQ6NXT2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3F3CQ6NXT2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3F3CQ6NXT2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3F3CQ6NXT2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3F3CQ6NXT2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3F3CQ6NXT2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3F3CQ6NXT2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3F3CQ6NXT2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3F3CQ6NXT2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3F3CQ6NXT2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3F3CQ6NXT2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3F3CQ6NXT2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3F3CQ6NXT2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3F3CQ6NXT2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3F3CQ6NXT2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3F3CQ6NXT2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3F3CQ6NXT2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3F3CQ6NXT2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3F3CQ6NXT2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3F3CQ6NXT2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3F3CQ6NXT2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3F3CQ6NXT2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3F3CQ6NXT2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3F3CQ6NXT2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H3F3CQ6NXT2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms