Protein–RNA interactions for Protein: Q6L8Q7

PDE12, 2',5'-phosphodiesterase 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE12Q6L8Q7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE12Q6L8Q7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE12Q6L8Q7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE12Q6L8Q7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE12Q6L8Q7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE12Q6L8Q7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE12Q6L8Q7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE12Q6L8Q7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE12Q6L8Q7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE12Q6L8Q7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE12Q6L8Q7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PDE12Q6L8Q7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE12Q6L8Q7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE12Q6L8Q7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE12Q6L8Q7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE12Q6L8Q7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE12Q6L8Q7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE12Q6L8Q7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE12Q6L8Q7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE12Q6L8Q7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE12Q6L8Q7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE12Q6L8Q7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE12Q6L8Q7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE12Q6L8Q7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE12Q6L8Q7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE12Q6L8Q7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE12Q6L8Q7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE12Q6L8Q7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE12Q6L8Q7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE12Q6L8Q7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE12Q6L8Q7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE12Q6L8Q7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDE12Q6L8Q7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE12Q6L8Q7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE12Q6L8Q7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE12Q6L8Q7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE12Q6L8Q7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE12Q6L8Q7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDE12Q6L8Q7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE12Q6L8Q7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE12Q6L8Q7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE12Q6L8Q7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE12Q6L8Q7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE12Q6L8Q7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE12Q6L8Q7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE12Q6L8Q7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDE12Q6L8Q7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE12Q6L8Q7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE12Q6L8Q7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE12Q6L8Q7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE12Q6L8Q7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE12Q6L8Q7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDE12Q6L8Q7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDE12Q6L8Q7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDE12Q6L8Q7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE12Q6L8Q7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE12Q6L8Q7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE12Q6L8Q7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE12Q6L8Q7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE12Q6L8Q7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE12Q6L8Q7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE12Q6L8Q7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE12Q6L8Q7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDE12Q6L8Q7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE12Q6L8Q7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE12Q6L8Q7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE12Q6L8Q7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE12Q6L8Q7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE12Q6L8Q7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE12Q6L8Q7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE12Q6L8Q7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PDE12Q6L8Q7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE12Q6L8Q7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE12Q6L8Q7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE12Q6L8Q7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE12Q6L8Q7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE12Q6L8Q7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE12Q6L8Q7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE12Q6L8Q7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE12Q6L8Q7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE12Q6L8Q7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PDE12Q6L8Q7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE12Q6L8Q7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE12Q6L8Q7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE12Q6L8Q7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE12Q6L8Q7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE12Q6L8Q7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE12Q6L8Q7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE12Q6L8Q7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE12Q6L8Q7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDE12Q6L8Q7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE12Q6L8Q7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE12Q6L8Q7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE12Q6L8Q7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE12Q6L8Q7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE12Q6L8Q7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PDE12Q6L8Q7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE12Q6L8Q7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE12Q6L8Q7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE12Q6L8Q7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms