Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RCSD1Q6JBY9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
RCSD1Q6JBY9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RCSD1Q6JBY9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RCSD1Q6JBY9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RCSD1Q6JBY9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RCSD1Q6JBY9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RCSD1Q6JBY9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RCSD1Q6JBY9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RCSD1Q6JBY9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RCSD1Q6JBY9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RCSD1Q6JBY9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RCSD1Q6JBY9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RCSD1Q6JBY9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RCSD1Q6JBY9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RCSD1Q6JBY9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RCSD1Q6JBY9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RCSD1Q6JBY9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RCSD1Q6JBY9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RCSD1Q6JBY9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RCSD1Q6JBY9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RCSD1Q6JBY9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RCSD1Q6JBY9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RCSD1Q6JBY9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RCSD1Q6JBY9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RCSD1Q6JBY9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RCSD1Q6JBY9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RCSD1Q6JBY9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RCSD1Q6JBY9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RCSD1Q6JBY9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RCSD1Q6JBY9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RCSD1Q6JBY9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RCSD1Q6JBY9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RCSD1Q6JBY9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RCSD1Q6JBY9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RCSD1Q6JBY9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RCSD1Q6JBY9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RCSD1Q6JBY9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RCSD1Q6JBY9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RCSD1Q6JBY9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RCSD1Q6JBY9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RCSD1Q6JBY9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RCSD1Q6JBY9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RCSD1Q6JBY9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RCSD1Q6JBY9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RCSD1Q6JBY9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RCSD1Q6JBY9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RCSD1Q6JBY9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RCSD1Q6JBY9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RCSD1Q6JBY9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RCSD1Q6JBY9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RCSD1Q6JBY9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RCSD1Q6JBY9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RCSD1Q6JBY9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RCSD1Q6JBY9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RCSD1Q6JBY9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RCSD1Q6JBY9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RCSD1Q6JBY9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RCSD1Q6JBY9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RCSD1Q6JBY9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RCSD1Q6JBY9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RCSD1Q6JBY9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RCSD1Q6JBY9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
RCSD1Q6JBY9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RCSD1Q6JBY9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RCSD1Q6JBY9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RCSD1Q6JBY9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RCSD1Q6JBY9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RCSD1Q6JBY9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RCSD1Q6JBY9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RCSD1Q6JBY9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RCSD1Q6JBY9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RCSD1Q6JBY9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RCSD1Q6JBY9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RCSD1Q6JBY9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RCSD1Q6JBY9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RCSD1Q6JBY9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RCSD1Q6JBY9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RCSD1Q6JBY9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RCSD1Q6JBY9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RCSD1Q6JBY9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RCSD1Q6JBY9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RCSD1Q6JBY9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RCSD1Q6JBY9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RCSD1Q6JBY9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RCSD1Q6JBY9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RCSD1Q6JBY9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RCSD1Q6JBY9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RCSD1Q6JBY9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RCSD1Q6JBY9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RCSD1Q6JBY9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RCSD1Q6JBY9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RCSD1Q6JBY9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RCSD1Q6JBY9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RCSD1Q6JBY9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RCSD1Q6JBY9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RCSD1Q6JBY9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RCSD1Q6JBY9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RCSD1Q6JBY9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RCSD1Q6JBY9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 220 ms