Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NCAPH2Q6IBW4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NCAPH2Q6IBW4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NCAPH2Q6IBW4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NCAPH2Q6IBW4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NCAPH2Q6IBW4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NCAPH2Q6IBW4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NCAPH2Q6IBW4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NCAPH2Q6IBW4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NCAPH2Q6IBW4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NCAPH2Q6IBW4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NCAPH2Q6IBW4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NCAPH2Q6IBW4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NCAPH2Q6IBW4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NCAPH2Q6IBW4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NCAPH2Q6IBW4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NCAPH2Q6IBW4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NCAPH2Q6IBW4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NCAPH2Q6IBW4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NCAPH2Q6IBW4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCAPH2Q6IBW4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCAPH2Q6IBW4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCAPH2Q6IBW4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCAPH2Q6IBW4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCAPH2Q6IBW4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCAPH2Q6IBW4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCAPH2Q6IBW4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCAPH2Q6IBW4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCAPH2Q6IBW4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCAPH2Q6IBW4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCAPH2Q6IBW4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCAPH2Q6IBW4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCAPH2Q6IBW4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCAPH2Q6IBW4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NCAPH2Q6IBW4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NCAPH2Q6IBW4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NCAPH2Q6IBW4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NCAPH2Q6IBW4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NCAPH2Q6IBW4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NCAPH2Q6IBW4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NCAPH2Q6IBW4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCAPH2Q6IBW4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NCAPH2Q6IBW4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCAPH2Q6IBW4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCAPH2Q6IBW4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCAPH2Q6IBW4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCAPH2Q6IBW4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCAPH2Q6IBW4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCAPH2Q6IBW4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCAPH2Q6IBW4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCAPH2Q6IBW4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCAPH2Q6IBW4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCAPH2Q6IBW4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCAPH2Q6IBW4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCAPH2Q6IBW4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCAPH2Q6IBW4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCAPH2Q6IBW4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCAPH2Q6IBW4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCAPH2Q6IBW4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NCAPH2Q6IBW4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCAPH2Q6IBW4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NCAPH2Q6IBW4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NCAPH2Q6IBW4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCAPH2Q6IBW4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCAPH2Q6IBW4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NCAPH2Q6IBW4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCAPH2Q6IBW4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCAPH2Q6IBW4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCAPH2Q6IBW4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCAPH2Q6IBW4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCAPH2Q6IBW4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCAPH2Q6IBW4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCAPH2Q6IBW4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCAPH2Q6IBW4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCAPH2Q6IBW4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCAPH2Q6IBW4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NCAPH2Q6IBW4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NCAPH2Q6IBW4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NCAPH2Q6IBW4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NCAPH2Q6IBW4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NCAPH2Q6IBW4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NCAPH2Q6IBW4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NCAPH2Q6IBW4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NCAPH2Q6IBW4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NCAPH2Q6IBW4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCAPH2Q6IBW4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCAPH2Q6IBW4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCAPH2Q6IBW4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCAPH2Q6IBW4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCAPH2Q6IBW4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCAPH2Q6IBW4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCAPH2Q6IBW4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCAPH2Q6IBW4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCAPH2Q6IBW4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCAPH2Q6IBW4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NCAPH2Q6IBW4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCAPH2Q6IBW4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCAPH2Q6IBW4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCAPH2Q6IBW4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NCAPH2Q6IBW4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms