Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ANKRD40Q6AI12 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ANKRD40Q6AI12 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ANKRD40Q6AI12 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ANKRD40Q6AI12 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ANKRD40Q6AI12 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ANKRD40Q6AI12 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ANKRD40Q6AI12 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ANKRD40Q6AI12 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ANKRD40Q6AI12 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ANKRD40Q6AI12 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ANKRD40Q6AI12 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ANKRD40Q6AI12 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ANKRD40Q6AI12 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ANKRD40Q6AI12 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ANKRD40Q6AI12 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ANKRD40Q6AI12 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ANKRD40Q6AI12 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ANKRD40Q6AI12 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ANKRD40Q6AI12 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ANKRD40Q6AI12 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ANKRD40Q6AI12 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ANKRD40Q6AI12 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ANKRD40Q6AI12 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ANKRD40Q6AI12 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ANKRD40Q6AI12 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ANKRD40Q6AI12 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ANKRD40Q6AI12 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ANKRD40Q6AI12 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ANKRD40Q6AI12 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ANKRD40Q6AI12 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ANKRD40Q6AI12 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ANKRD40Q6AI12 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ANKRD40Q6AI12 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ANKRD40Q6AI12 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ANKRD40Q6AI12 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ANKRD40Q6AI12 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ANKRD40Q6AI12 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ANKRD40Q6AI12 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ANKRD40Q6AI12 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ANKRD40Q6AI12 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ANKRD40Q6AI12 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ANKRD40Q6AI12 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ANKRD40Q6AI12 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ANKRD40Q6AI12 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ANKRD40Q6AI12 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ANKRD40Q6AI12 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ANKRD40Q6AI12 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ANKRD40Q6AI12 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ANKRD40Q6AI12 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ANKRD40Q6AI12 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ANKRD40Q6AI12 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ANKRD40Q6AI12 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ANKRD40Q6AI12 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ANKRD40Q6AI12 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ANKRD40Q6AI12 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ANKRD40Q6AI12 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ANKRD40Q6AI12 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ANKRD40Q6AI12 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ANKRD40Q6AI12 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ANKRD40Q6AI12 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ANKRD40Q6AI12 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ANKRD40Q6AI12 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ANKRD40Q6AI12 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ANKRD40Q6AI12 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ANKRD40Q6AI12 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ANKRD40Q6AI12 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ANKRD40Q6AI12 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ANKRD40Q6AI12 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ANKRD40Q6AI12 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ANKRD40Q6AI12 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ANKRD40Q6AI12 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ANKRD40Q6AI12 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ANKRD40Q6AI12 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ANKRD40Q6AI12 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ANKRD40Q6AI12 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ANKRD40Q6AI12 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ANKRD40Q6AI12 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ANKRD40Q6AI12 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ANKRD40Q6AI12 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ANKRD40Q6AI12 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ANKRD40Q6AI12 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ANKRD40Q6AI12 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ANKRD40Q6AI12 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ANKRD40Q6AI12 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ANKRD40Q6AI12 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ANKRD40Q6AI12 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ANKRD40Q6AI12 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ANKRD40Q6AI12 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ANKRD40Q6AI12 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ANKRD40Q6AI12 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ANKRD40Q6AI12 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ANKRD40Q6AI12 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ANKRD40Q6AI12 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ANKRD40Q6AI12 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ANKRD40Q6AI12 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ANKRD40Q6AI12 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ANKRD40Q6AI12 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ANKRD40Q6AI12 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ANKRD40Q6AI12 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms