Protein–RNA interactions for Protein: Q68DV7

RNF43, E3 ubiquitin-protein ligase RNF43, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF43Q68DV7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF43Q68DV7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF43Q68DV7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF43Q68DV7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF43Q68DV7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF43Q68DV7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF43Q68DV7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF43Q68DV7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF43Q68DV7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF43Q68DV7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF43Q68DV7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF43Q68DV7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF43Q68DV7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF43Q68DV7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF43Q68DV7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF43Q68DV7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF43Q68DV7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF43Q68DV7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF43Q68DV7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF43Q68DV7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF43Q68DV7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF43Q68DV7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF43Q68DV7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF43Q68DV7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF43Q68DV7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF43Q68DV7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF43Q68DV7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF43Q68DV7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF43Q68DV7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF43Q68DV7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF43Q68DV7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF43Q68DV7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF43Q68DV7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF43Q68DV7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF43Q68DV7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF43Q68DV7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF43Q68DV7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF43Q68DV7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF43Q68DV7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF43Q68DV7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF43Q68DV7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF43Q68DV7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF43Q68DV7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF43Q68DV7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF43Q68DV7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF43Q68DV7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF43Q68DV7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF43Q68DV7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF43Q68DV7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF43Q68DV7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF43Q68DV7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF43Q68DV7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF43Q68DV7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF43Q68DV7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF43Q68DV7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF43Q68DV7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF43Q68DV7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF43Q68DV7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF43Q68DV7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF43Q68DV7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF43Q68DV7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF43Q68DV7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF43Q68DV7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF43Q68DV7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF43Q68DV7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF43Q68DV7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RNF43Q68DV7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RNF43Q68DV7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RNF43Q68DV7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF43Q68DV7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF43Q68DV7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF43Q68DV7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF43Q68DV7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF43Q68DV7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF43Q68DV7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF43Q68DV7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF43Q68DV7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF43Q68DV7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF43Q68DV7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF43Q68DV7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF43Q68DV7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF43Q68DV7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF43Q68DV7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF43Q68DV7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF43Q68DV7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF43Q68DV7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF43Q68DV7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF43Q68DV7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF43Q68DV7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF43Q68DV7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF43Q68DV7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF43Q68DV7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF43Q68DV7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF43Q68DV7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF43Q68DV7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF43Q68DV7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF43Q68DV7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF43Q68DV7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF43Q68DV7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF43Q68DV7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms