Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SHEQ5VZ18 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SHEQ5VZ18 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SHEQ5VZ18 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SHEQ5VZ18 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHEQ5VZ18 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHEQ5VZ18 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHEQ5VZ18 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHEQ5VZ18 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHEQ5VZ18 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHEQ5VZ18 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHEQ5VZ18 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHEQ5VZ18 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHEQ5VZ18 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHEQ5VZ18 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SHEQ5VZ18 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHEQ5VZ18 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHEQ5VZ18 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHEQ5VZ18 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHEQ5VZ18 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHEQ5VZ18 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHEQ5VZ18 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SHEQ5VZ18 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHEQ5VZ18 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SHEQ5VZ18 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHEQ5VZ18 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SHEQ5VZ18 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SHEQ5VZ18 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHEQ5VZ18 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHEQ5VZ18 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHEQ5VZ18 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHEQ5VZ18 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHEQ5VZ18 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SHEQ5VZ18 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SHEQ5VZ18 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms