Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXT5

SYPL2, Synaptophysin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL2Q5VXT5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYPL2Q5VXT5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYPL2Q5VXT5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYPL2Q5VXT5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYPL2Q5VXT5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYPL2Q5VXT5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYPL2Q5VXT5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYPL2Q5VXT5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYPL2Q5VXT5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYPL2Q5VXT5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SYPL2Q5VXT5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYPL2Q5VXT5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYPL2Q5VXT5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYPL2Q5VXT5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYPL2Q5VXT5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYPL2Q5VXT5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYPL2Q5VXT5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYPL2Q5VXT5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYPL2Q5VXT5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYPL2Q5VXT5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYPL2Q5VXT5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYPL2Q5VXT5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYPL2Q5VXT5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYPL2Q5VXT5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYPL2Q5VXT5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYPL2Q5VXT5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYPL2Q5VXT5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYPL2Q5VXT5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYPL2Q5VXT5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SYPL2Q5VXT5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYPL2Q5VXT5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYPL2Q5VXT5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYPL2Q5VXT5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYPL2Q5VXT5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYPL2Q5VXT5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYPL2Q5VXT5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYPL2Q5VXT5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYPL2Q5VXT5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SYPL2Q5VXT5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYPL2Q5VXT5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYPL2Q5VXT5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYPL2Q5VXT5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYPL2Q5VXT5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYPL2Q5VXT5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYPL2Q5VXT5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYPL2Q5VXT5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYPL2Q5VXT5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYPL2Q5VXT5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYPL2Q5VXT5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYPL2Q5VXT5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYPL2Q5VXT5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYPL2Q5VXT5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SYPL2Q5VXT5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYPL2Q5VXT5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYPL2Q5VXT5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYPL2Q5VXT5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SYPL2Q5VXT5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYPL2Q5VXT5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYPL2Q5VXT5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYPL2Q5VXT5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SYPL2Q5VXT5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYPL2Q5VXT5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYPL2Q5VXT5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYPL2Q5VXT5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYPL2Q5VXT5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYPL2Q5VXT5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYPL2Q5VXT5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYPL2Q5VXT5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYPL2Q5VXT5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYPL2Q5VXT5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYPL2Q5VXT5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYPL2Q5VXT5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYPL2Q5VXT5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SYPL2Q5VXT5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYPL2Q5VXT5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYPL2Q5VXT5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYPL2Q5VXT5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYPL2Q5VXT5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYPL2Q5VXT5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYPL2Q5VXT5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYPL2Q5VXT5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYPL2Q5VXT5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYPL2Q5VXT5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYPL2Q5VXT5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYPL2Q5VXT5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYPL2Q5VXT5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYPL2Q5VXT5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYPL2Q5VXT5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYPL2Q5VXT5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYPL2Q5VXT5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYPL2Q5VXT5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYPL2Q5VXT5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYPL2Q5VXT5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYPL2Q5VXT5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYPL2Q5VXT5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYPL2Q5VXT5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYPL2Q5VXT5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYPL2Q5VXT5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SYPL2Q5VXT5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SYPL2Q5VXT5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms