Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM3

PRAMEF18, PRAME family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF18Q5VWM3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRAMEF18Q5VWM3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRAMEF18Q5VWM3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRAMEF18Q5VWM3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRAMEF18Q5VWM3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRAMEF18Q5VWM3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRAMEF18Q5VWM3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRAMEF18Q5VWM3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRAMEF18Q5VWM3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRAMEF18Q5VWM3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRAMEF18Q5VWM3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRAMEF18Q5VWM3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRAMEF18Q5VWM3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PRAMEF18Q5VWM3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PRAMEF18Q5VWM3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRAMEF18Q5VWM3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRAMEF18Q5VWM3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRAMEF18Q5VWM3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PRAMEF18Q5VWM3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRAMEF18Q5VWM3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PRAMEF18Q5VWM3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRAMEF18Q5VWM3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRAMEF18Q5VWM3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRAMEF18Q5VWM3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRAMEF18Q5VWM3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRAMEF18Q5VWM3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRAMEF18Q5VWM3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRAMEF18Q5VWM3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRAMEF18Q5VWM3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PRAMEF18Q5VWM3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PRAMEF18Q5VWM3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
PRAMEF18Q5VWM3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PRAMEF18Q5VWM3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PRAMEF18Q5VWM3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PRAMEF18Q5VWM3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PRAMEF18Q5VWM3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRAMEF18Q5VWM3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRAMEF18Q5VWM3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRAMEF18Q5VWM3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRAMEF18Q5VWM3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PRAMEF18Q5VWM3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PRAMEF18Q5VWM3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRAMEF18Q5VWM3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRAMEF18Q5VWM3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRAMEF18Q5VWM3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRAMEF18Q5VWM3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PRAMEF18Q5VWM3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRAMEF18Q5VWM3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRAMEF18Q5VWM3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRAMEF18Q5VWM3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRAMEF18Q5VWM3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRAMEF18Q5VWM3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRAMEF18Q5VWM3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRAMEF18Q5VWM3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRAMEF18Q5VWM3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PRAMEF18Q5VWM3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRAMEF18Q5VWM3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRAMEF18Q5VWM3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRAMEF18Q5VWM3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PRAMEF18Q5VWM3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRAMEF18Q5VWM3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRAMEF18Q5VWM3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRAMEF18Q5VWM3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRAMEF18Q5VWM3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRAMEF18Q5VWM3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PRAMEF18Q5VWM3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRAMEF18Q5VWM3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PRAMEF18Q5VWM3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRAMEF18Q5VWM3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRAMEF18Q5VWM3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRAMEF18Q5VWM3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRAMEF18Q5VWM3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRAMEF18Q5VWM3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRAMEF18Q5VWM3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRAMEF18Q5VWM3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PRAMEF18Q5VWM3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRAMEF18Q5VWM3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRAMEF18Q5VWM3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRAMEF18Q5VWM3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PRAMEF18Q5VWM3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRAMEF18Q5VWM3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRAMEF18Q5VWM3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PRAMEF18Q5VWM3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PRAMEF18Q5VWM3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PRAMEF18Q5VWM3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRAMEF18Q5VWM3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRAMEF18Q5VWM3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PRAMEF18Q5VWM3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PRAMEF18Q5VWM3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRAMEF18Q5VWM3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PRAMEF18Q5VWM3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PRAMEF18Q5VWM3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRAMEF18Q5VWM3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRAMEF18Q5VWM3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRAMEF18Q5VWM3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRAMEF18Q5VWM3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PRAMEF18Q5VWM3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRAMEF18Q5VWM3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRAMEF18Q5VWM3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms