Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWI1

TCERG1L, Transcription elongation regulator 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCERG1LQ5VWI1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCERG1LQ5VWI1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCERG1LQ5VWI1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCERG1LQ5VWI1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCERG1LQ5VWI1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCERG1LQ5VWI1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCERG1LQ5VWI1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCERG1LQ5VWI1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCERG1LQ5VWI1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCERG1LQ5VWI1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCERG1LQ5VWI1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCERG1LQ5VWI1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCERG1LQ5VWI1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCERG1LQ5VWI1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCERG1LQ5VWI1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCERG1LQ5VWI1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCERG1LQ5VWI1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCERG1LQ5VWI1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TCERG1LQ5VWI1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCERG1LQ5VWI1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCERG1LQ5VWI1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCERG1LQ5VWI1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCERG1LQ5VWI1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCERG1LQ5VWI1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCERG1LQ5VWI1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TCERG1LQ5VWI1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TCERG1LQ5VWI1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TCERG1LQ5VWI1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TCERG1LQ5VWI1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TCERG1LQ5VWI1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCERG1LQ5VWI1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCERG1LQ5VWI1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCERG1LQ5VWI1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TCERG1LQ5VWI1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCERG1LQ5VWI1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCERG1LQ5VWI1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCERG1LQ5VWI1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCERG1LQ5VWI1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCERG1LQ5VWI1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCERG1LQ5VWI1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCERG1LQ5VWI1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCERG1LQ5VWI1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCERG1LQ5VWI1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCERG1LQ5VWI1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCERG1LQ5VWI1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCERG1LQ5VWI1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCERG1LQ5VWI1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TCERG1LQ5VWI1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCERG1LQ5VWI1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCERG1LQ5VWI1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCERG1LQ5VWI1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCERG1LQ5VWI1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCERG1LQ5VWI1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCERG1LQ5VWI1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCERG1LQ5VWI1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCERG1LQ5VWI1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCERG1LQ5VWI1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TCERG1LQ5VWI1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCERG1LQ5VWI1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCERG1LQ5VWI1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCERG1LQ5VWI1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCERG1LQ5VWI1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCERG1LQ5VWI1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCERG1LQ5VWI1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCERG1LQ5VWI1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCERG1LQ5VWI1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCERG1LQ5VWI1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCERG1LQ5VWI1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCERG1LQ5VWI1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCERG1LQ5VWI1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCERG1LQ5VWI1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCERG1LQ5VWI1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCERG1LQ5VWI1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCERG1LQ5VWI1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCERG1LQ5VWI1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCERG1LQ5VWI1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCERG1LQ5VWI1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCERG1LQ5VWI1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCERG1LQ5VWI1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCERG1LQ5VWI1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TCERG1LQ5VWI1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCERG1LQ5VWI1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCERG1LQ5VWI1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCERG1LQ5VWI1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCERG1LQ5VWI1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TCERG1LQ5VWI1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCERG1LQ5VWI1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCERG1LQ5VWI1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCERG1LQ5VWI1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCERG1LQ5VWI1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCERG1LQ5VWI1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCERG1LQ5VWI1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCERG1LQ5VWI1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCERG1LQ5VWI1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCERG1LQ5VWI1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCERG1LQ5VWI1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCERG1LQ5VWI1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCERG1LQ5VWI1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCERG1LQ5VWI1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCERG1LQ5VWI1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms