Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BROXQ5VW32 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BROXQ5VW32 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BROXQ5VW32 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BROXQ5VW32 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BROXQ5VW32 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BROXQ5VW32 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BROXQ5VW32 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BROXQ5VW32 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BROXQ5VW32 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BROXQ5VW32 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BROXQ5VW32 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BROXQ5VW32 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BROXQ5VW32 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BROXQ5VW32 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BROXQ5VW32 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BROXQ5VW32 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BROXQ5VW32 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BROXQ5VW32 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BROXQ5VW32 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BROXQ5VW32 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BROXQ5VW32 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BROXQ5VW32 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BROXQ5VW32 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BROXQ5VW32 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BROXQ5VW32 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BROXQ5VW32 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BROXQ5VW32 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BROXQ5VW32 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BROXQ5VW32 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BROXQ5VW32 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BROXQ5VW32 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BROXQ5VW32 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BROXQ5VW32 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BROXQ5VW32 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BROXQ5VW32 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BROXQ5VW32 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BROXQ5VW32 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BROXQ5VW32 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BROXQ5VW32 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BROXQ5VW32 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BROXQ5VW32 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BROXQ5VW32 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BROXQ5VW32 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BROXQ5VW32 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BROXQ5VW32 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BROXQ5VW32 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BROXQ5VW32 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BROXQ5VW32 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BROXQ5VW32 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BROXQ5VW32 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BROXQ5VW32 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BROXQ5VW32 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BROXQ5VW32 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BROXQ5VW32 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BROXQ5VW32 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BROXQ5VW32 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BROXQ5VW32 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BROXQ5VW32 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BROXQ5VW32 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BROXQ5VW32 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BROXQ5VW32 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BROXQ5VW32 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BROXQ5VW32 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BROXQ5VW32 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BROXQ5VW32 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BROXQ5VW32 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BROXQ5VW32 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BROXQ5VW32 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BROXQ5VW32 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
BROXQ5VW32 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BROXQ5VW32 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BROXQ5VW32 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BROXQ5VW32 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BROXQ5VW32 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BROXQ5VW32 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BROXQ5VW32 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BROXQ5VW32 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BROXQ5VW32 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BROXQ5VW32 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BROXQ5VW32 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BROXQ5VW32 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BROXQ5VW32 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BROXQ5VW32 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BROXQ5VW32 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BROXQ5VW32 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BROXQ5VW32 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BROXQ5VW32 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BROXQ5VW32 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BROXQ5VW32 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BROXQ5VW32 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BROXQ5VW32 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BROXQ5VW32 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BROXQ5VW32 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BROXQ5VW32 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BROXQ5VW32 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BROXQ5VW32 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BROXQ5VW32 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BROXQ5VW32 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BROXQ5VW32 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms