Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV63

ATRNL1, Attractin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1Q5VV63 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATRNL1Q5VV63 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATRNL1Q5VV63 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATRNL1Q5VV63 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATRNL1Q5VV63 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATRNL1Q5VV63 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATRNL1Q5VV63 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ATRNL1Q5VV63 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATRNL1Q5VV63 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATRNL1Q5VV63 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATRNL1Q5VV63 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATRNL1Q5VV63 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATRNL1Q5VV63 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATRNL1Q5VV63 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATRNL1Q5VV63 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATRNL1Q5VV63 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATRNL1Q5VV63 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATRNL1Q5VV63 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATRNL1Q5VV63 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATRNL1Q5VV63 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATRNL1Q5VV63 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATRNL1Q5VV63 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATRNL1Q5VV63 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ATRNL1Q5VV63 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ATRNL1Q5VV63 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ATRNL1Q5VV63 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATRNL1Q5VV63 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ATRNL1Q5VV63 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATRNL1Q5VV63 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATRNL1Q5VV63 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATRNL1Q5VV63 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ATRNL1Q5VV63 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ATRNL1Q5VV63 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ATRNL1Q5VV63 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ATRNL1Q5VV63 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATRNL1Q5VV63 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.55■■■□□ 2
ATRNL1Q5VV63 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ATRNL1Q5VV63 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ATRNL1Q5VV63 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ATRNL1Q5VV63 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ATRNL1Q5VV63 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATRNL1Q5VV63 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATRNL1Q5VV63 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ATRNL1Q5VV63 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATRNL1Q5VV63 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ATRNL1Q5VV63 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATRNL1Q5VV63 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ATRNL1Q5VV63 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATRNL1Q5VV63 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ATRNL1Q5VV63 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ATRNL1Q5VV63 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATRNL1Q5VV63 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATRNL1Q5VV63 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATRNL1Q5VV63 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ATRNL1Q5VV63 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATRNL1Q5VV63 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATRNL1Q5VV63 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATRNL1Q5VV63 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATRNL1Q5VV63 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATRNL1Q5VV63 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATRNL1Q5VV63 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATRNL1Q5VV63 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATRNL1Q5VV63 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATRNL1Q5VV63 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATRNL1Q5VV63 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATRNL1Q5VV63 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATRNL1Q5VV63 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ATRNL1Q5VV63 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATRNL1Q5VV63 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATRNL1Q5VV63 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATRNL1Q5VV63 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATRNL1Q5VV63 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATRNL1Q5VV63 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATRNL1Q5VV63 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATRNL1Q5VV63 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATRNL1Q5VV63 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATRNL1Q5VV63 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATRNL1Q5VV63 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATRNL1Q5VV63 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATRNL1Q5VV63 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATRNL1Q5VV63 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATRNL1Q5VV63 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATRNL1Q5VV63 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATRNL1Q5VV63 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATRNL1Q5VV63 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATRNL1Q5VV63 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATRNL1Q5VV63 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATRNL1Q5VV63 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ATRNL1Q5VV63 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATRNL1Q5VV63 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ATRNL1Q5VV63 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ATRNL1Q5VV63 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ATRNL1Q5VV63 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATRNL1Q5VV63 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATRNL1Q5VV63 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ATRNL1Q5VV63 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATRNL1Q5VV63 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATRNL1Q5VV63 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ATRNL1Q5VV63 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATRNL1Q5VV63 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms