Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C1orf53Q5VUE5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C1orf53Q5VUE5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C1orf53Q5VUE5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C1orf53Q5VUE5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C1orf53Q5VUE5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C1orf53Q5VUE5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C1orf53Q5VUE5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C1orf53Q5VUE5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C1orf53Q5VUE5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C1orf53Q5VUE5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C1orf53Q5VUE5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C1orf53Q5VUE5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C1orf53Q5VUE5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C1orf53Q5VUE5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C1orf53Q5VUE5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C1orf53Q5VUE5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C1orf53Q5VUE5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C1orf53Q5VUE5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C1orf53Q5VUE5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
C1orf53Q5VUE5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
C1orf53Q5VUE5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
C1orf53Q5VUE5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
C1orf53Q5VUE5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
C1orf53Q5VUE5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
C1orf53Q5VUE5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
C1orf53Q5VUE5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
C1orf53Q5VUE5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C1orf53Q5VUE5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C1orf53Q5VUE5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C1orf53Q5VUE5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C1orf53Q5VUE5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C1orf53Q5VUE5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C1orf53Q5VUE5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C1orf53Q5VUE5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C1orf53Q5VUE5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C1orf53Q5VUE5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C1orf53Q5VUE5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C1orf53Q5VUE5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C1orf53Q5VUE5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C1orf53Q5VUE5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C1orf53Q5VUE5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C1orf53Q5VUE5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C1orf53Q5VUE5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C1orf53Q5VUE5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C1orf53Q5VUE5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C1orf53Q5VUE5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C1orf53Q5VUE5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C1orf53Q5VUE5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C1orf53Q5VUE5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C1orf53Q5VUE5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C1orf53Q5VUE5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C1orf53Q5VUE5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C1orf53Q5VUE5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C1orf53Q5VUE5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C1orf53Q5VUE5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C1orf53Q5VUE5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C1orf53Q5VUE5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C1orf53Q5VUE5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C1orf53Q5VUE5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C1orf53Q5VUE5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
C1orf53Q5VUE5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C1orf53Q5VUE5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
C1orf53Q5VUE5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C1orf53Q5VUE5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C1orf53Q5VUE5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C1orf53Q5VUE5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C1orf53Q5VUE5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
C1orf53Q5VUE5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C1orf53Q5VUE5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C1orf53Q5VUE5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C1orf53Q5VUE5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C1orf53Q5VUE5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
C1orf53Q5VUE5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
C1orf53Q5VUE5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
C1orf53Q5VUE5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
C1orf53Q5VUE5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
C1orf53Q5VUE5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C1orf53Q5VUE5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
C1orf53Q5VUE5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
C1orf53Q5VUE5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C1orf53Q5VUE5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
C1orf53Q5VUE5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
C1orf53Q5VUE5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
C1orf53Q5VUE5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
C1orf53Q5VUE5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C1orf53Q5VUE5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C1orf53Q5VUE5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C1orf53Q5VUE5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
C1orf53Q5VUE5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C1orf53Q5VUE5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C1orf53Q5VUE5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C1orf53Q5VUE5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C1orf53Q5VUE5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
C1orf53Q5VUE5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C1orf53Q5VUE5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C1orf53Q5VUE5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
C1orf53Q5VUE5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C1orf53Q5VUE5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C1orf53Q5VUE5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.8 ms