Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGAP9Q5VTM2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGAP9Q5VTM2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGAP9Q5VTM2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGAP9Q5VTM2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGAP9Q5VTM2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
AGAP9Q5VTM2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGAP9Q5VTM2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGAP9Q5VTM2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGAP9Q5VTM2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGAP9Q5VTM2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGAP9Q5VTM2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGAP9Q5VTM2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGAP9Q5VTM2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGAP9Q5VTM2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGAP9Q5VTM2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGAP9Q5VTM2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGAP9Q5VTM2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGAP9Q5VTM2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGAP9Q5VTM2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGAP9Q5VTM2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGAP9Q5VTM2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGAP9Q5VTM2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGAP9Q5VTM2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
AGAP9Q5VTM2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGAP9Q5VTM2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGAP9Q5VTM2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AGAP9Q5VTM2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AGAP9Q5VTM2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AGAP9Q5VTM2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AGAP9Q5VTM2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AGAP9Q5VTM2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AGAP9Q5VTM2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AGAP9Q5VTM2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AGAP9Q5VTM2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AGAP9Q5VTM2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AGAP9Q5VTM2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AGAP9Q5VTM2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AGAP9Q5VTM2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AGAP9Q5VTM2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGAP9Q5VTM2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGAP9Q5VTM2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGAP9Q5VTM2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGAP9Q5VTM2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGAP9Q5VTM2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGAP9Q5VTM2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGAP9Q5VTM2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AGAP9Q5VTM2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AGAP9Q5VTM2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
AGAP9Q5VTM2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AGAP9Q5VTM2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
AGAP9Q5VTM2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AGAP9Q5VTM2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AGAP9Q5VTM2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AGAP9Q5VTM2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AGAP9Q5VTM2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AGAP9Q5VTM2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGAP9Q5VTM2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGAP9Q5VTM2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGAP9Q5VTM2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGAP9Q5VTM2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AGAP9Q5VTM2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AGAP9Q5VTM2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AGAP9Q5VTM2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AGAP9Q5VTM2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AGAP9Q5VTM2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AGAP9Q5VTM2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AGAP9Q5VTM2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AGAP9Q5VTM2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
AGAP9Q5VTM2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AGAP9Q5VTM2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AGAP9Q5VTM2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGAP9Q5VTM2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGAP9Q5VTM2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGAP9Q5VTM2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGAP9Q5VTM2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGAP9Q5VTM2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGAP9Q5VTM2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGAP9Q5VTM2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGAP9Q5VTM2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGAP9Q5VTM2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGAP9Q5VTM2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGAP9Q5VTM2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGAP9Q5VTM2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGAP9Q5VTM2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGAP9Q5VTM2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGAP9Q5VTM2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGAP9Q5VTM2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGAP9Q5VTM2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGAP9Q5VTM2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AGAP9Q5VTM2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AGAP9Q5VTM2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AGAP9Q5VTM2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
AGAP9Q5VTM2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
AGAP9Q5VTM2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AGAP9Q5VTM2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
AGAP9Q5VTM2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AGAP9Q5VTM2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AGAP9Q5VTM2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AGAP9Q5VTM2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms