Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RNF220Q5VTB9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF220Q5VTB9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF220Q5VTB9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF220Q5VTB9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF220Q5VTB9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF220Q5VTB9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF220Q5VTB9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF220Q5VTB9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF220Q5VTB9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF220Q5VTB9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF220Q5VTB9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF220Q5VTB9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF220Q5VTB9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF220Q5VTB9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF220Q5VTB9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF220Q5VTB9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF220Q5VTB9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF220Q5VTB9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF220Q5VTB9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF220Q5VTB9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF220Q5VTB9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF220Q5VTB9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF220Q5VTB9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF220Q5VTB9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF220Q5VTB9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF220Q5VTB9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF220Q5VTB9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF220Q5VTB9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF220Q5VTB9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF220Q5VTB9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF220Q5VTB9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF220Q5VTB9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF220Q5VTB9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF220Q5VTB9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF220Q5VTB9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF220Q5VTB9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF220Q5VTB9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF220Q5VTB9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF220Q5VTB9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF220Q5VTB9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF220Q5VTB9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF220Q5VTB9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF220Q5VTB9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF220Q5VTB9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF220Q5VTB9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF220Q5VTB9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF220Q5VTB9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF220Q5VTB9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF220Q5VTB9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF220Q5VTB9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF220Q5VTB9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF220Q5VTB9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF220Q5VTB9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF220Q5VTB9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF220Q5VTB9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF220Q5VTB9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF220Q5VTB9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF220Q5VTB9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF220Q5VTB9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF220Q5VTB9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF220Q5VTB9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF220Q5VTB9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF220Q5VTB9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF220Q5VTB9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF220Q5VTB9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF220Q5VTB9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF220Q5VTB9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF220Q5VTB9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF220Q5VTB9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF220Q5VTB9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF220Q5VTB9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF220Q5VTB9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF220Q5VTB9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF220Q5VTB9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF220Q5VTB9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF220Q5VTB9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF220Q5VTB9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF220Q5VTB9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF220Q5VTB9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF220Q5VTB9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF220Q5VTB9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF220Q5VTB9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF220Q5VTB9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF220Q5VTB9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF220Q5VTB9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF220Q5VTB9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF220Q5VTB9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF220Q5VTB9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF220Q5VTB9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF220Q5VTB9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF220Q5VTB9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms