Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9S5

CCDC18, Coiled-coil domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18Q5T9S5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CCDC18Q5T9S5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CCDC18Q5T9S5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CCDC18Q5T9S5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CCDC18Q5T9S5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CCDC18Q5T9S5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CCDC18Q5T9S5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CCDC18Q5T9S5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CCDC18Q5T9S5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CCDC18Q5T9S5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CCDC18Q5T9S5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
CCDC18Q5T9S5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CCDC18Q5T9S5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CCDC18Q5T9S5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CCDC18Q5T9S5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CCDC18Q5T9S5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
CCDC18Q5T9S5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CCDC18Q5T9S5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CCDC18Q5T9S5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CCDC18Q5T9S5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
CCDC18Q5T9S5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CCDC18Q5T9S5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CCDC18Q5T9S5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CCDC18Q5T9S5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CCDC18Q5T9S5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CCDC18Q5T9S5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CCDC18Q5T9S5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CCDC18Q5T9S5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
CCDC18Q5T9S5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CCDC18Q5T9S5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CCDC18Q5T9S5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CCDC18Q5T9S5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CCDC18Q5T9S5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CCDC18Q5T9S5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CCDC18Q5T9S5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CCDC18Q5T9S5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CCDC18Q5T9S5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CCDC18Q5T9S5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
CCDC18Q5T9S5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CCDC18Q5T9S5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.41
CCDC18Q5T9S5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
CCDC18Q5T9S5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CCDC18Q5T9S5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
CCDC18Q5T9S5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CCDC18Q5T9S5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CCDC18Q5T9S5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CCDC18Q5T9S5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CCDC18Q5T9S5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CCDC18Q5T9S5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CCDC18Q5T9S5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CCDC18Q5T9S5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CCDC18Q5T9S5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CCDC18Q5T9S5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CCDC18Q5T9S5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CCDC18Q5T9S5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CCDC18Q5T9S5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CCDC18Q5T9S5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CCDC18Q5T9S5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CCDC18Q5T9S5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CCDC18Q5T9S5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CCDC18Q5T9S5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CCDC18Q5T9S5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CCDC18Q5T9S5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CCDC18Q5T9S5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CCDC18Q5T9S5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CCDC18Q5T9S5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
CCDC18Q5T9S5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CCDC18Q5T9S5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
CCDC18Q5T9S5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
CCDC18Q5T9S5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
CCDC18Q5T9S5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
CCDC18Q5T9S5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
CCDC18Q5T9S5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
CCDC18Q5T9S5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CCDC18Q5T9S5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CCDC18Q5T9S5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CCDC18Q5T9S5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CCDC18Q5T9S5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CCDC18Q5T9S5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CCDC18Q5T9S5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CCDC18Q5T9S5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
CCDC18Q5T9S5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CCDC18Q5T9S5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CCDC18Q5T9S5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CCDC18Q5T9S5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CCDC18Q5T9S5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CCDC18Q5T9S5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CCDC18Q5T9S5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CCDC18Q5T9S5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CCDC18Q5T9S5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CCDC18Q5T9S5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CCDC18Q5T9S5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CCDC18Q5T9S5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CCDC18Q5T9S5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CCDC18Q5T9S5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
CCDC18Q5T9S5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CCDC18Q5T9S5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CCDC18Q5T9S5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CCDC18Q5T9S5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CCDC18Q5T9S5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms