Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P3

LCE1B, Late cornified envelope protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCE1BQ5T7P3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
LCE1BQ5T7P3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms