Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBAP2Q5T6F2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBAP2Q5T6F2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
UBAP2Q5T6F2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBAP2Q5T6F2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBAP2Q5T6F2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBAP2Q5T6F2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBAP2Q5T6F2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBAP2Q5T6F2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBAP2Q5T6F2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBAP2Q5T6F2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBAP2Q5T6F2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBAP2Q5T6F2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBAP2Q5T6F2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBAP2Q5T6F2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBAP2Q5T6F2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBAP2Q5T6F2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBAP2Q5T6F2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBAP2Q5T6F2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBAP2Q5T6F2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBAP2Q5T6F2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBAP2Q5T6F2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBAP2Q5T6F2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBAP2Q5T6F2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBAP2Q5T6F2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBAP2Q5T6F2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBAP2Q5T6F2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBAP2Q5T6F2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBAP2Q5T6F2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBAP2Q5T6F2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBAP2Q5T6F2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBAP2Q5T6F2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBAP2Q5T6F2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBAP2Q5T6F2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
UBAP2Q5T6F2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBAP2Q5T6F2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBAP2Q5T6F2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBAP2Q5T6F2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBAP2Q5T6F2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBAP2Q5T6F2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBAP2Q5T6F2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBAP2Q5T6F2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBAP2Q5T6F2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBAP2Q5T6F2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBAP2Q5T6F2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBAP2Q5T6F2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBAP2Q5T6F2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBAP2Q5T6F2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBAP2Q5T6F2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBAP2Q5T6F2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBAP2Q5T6F2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBAP2Q5T6F2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBAP2Q5T6F2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBAP2Q5T6F2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBAP2Q5T6F2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBAP2Q5T6F2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBAP2Q5T6F2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBAP2Q5T6F2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBAP2Q5T6F2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBAP2Q5T6F2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBAP2Q5T6F2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
UBAP2Q5T6F2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBAP2Q5T6F2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
UBAP2Q5T6F2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBAP2Q5T6F2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBAP2Q5T6F2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBAP2Q5T6F2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBAP2Q5T6F2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBAP2Q5T6F2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBAP2Q5T6F2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBAP2Q5T6F2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBAP2Q5T6F2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBAP2Q5T6F2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBAP2Q5T6F2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBAP2Q5T6F2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBAP2Q5T6F2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBAP2Q5T6F2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBAP2Q5T6F2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
UBAP2Q5T6F2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
UBAP2Q5T6F2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
UBAP2Q5T6F2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBAP2Q5T6F2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBAP2Q5T6F2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBAP2Q5T6F2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBAP2Q5T6F2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBAP2Q5T6F2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBAP2Q5T6F2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBAP2Q5T6F2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBAP2Q5T6F2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBAP2Q5T6F2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
UBAP2Q5T6F2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
UBAP2Q5T6F2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBAP2Q5T6F2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBAP2Q5T6F2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBAP2Q5T6F2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBAP2Q5T6F2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBAP2Q5T6F2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBAP2Q5T6F2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBAP2Q5T6F2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBAP2Q5T6F2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms