Protein–RNA interactions for Protein: Q5T447

HECTD3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD3Q5T447 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HECTD3Q5T447 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HECTD3Q5T447 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HECTD3Q5T447 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HECTD3Q5T447 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HECTD3Q5T447 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HECTD3Q5T447 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HECTD3Q5T447 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HECTD3Q5T447 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HECTD3Q5T447 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HECTD3Q5T447 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HECTD3Q5T447 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HECTD3Q5T447 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HECTD3Q5T447 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HECTD3Q5T447 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HECTD3Q5T447 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HECTD3Q5T447 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HECTD3Q5T447 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HECTD3Q5T447 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HECTD3Q5T447 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HECTD3Q5T447 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HECTD3Q5T447 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HECTD3Q5T447 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HECTD3Q5T447 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HECTD3Q5T447 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HECTD3Q5T447 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HECTD3Q5T447 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HECTD3Q5T447 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HECTD3Q5T447 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HECTD3Q5T447 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HECTD3Q5T447 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HECTD3Q5T447 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HECTD3Q5T447 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HECTD3Q5T447 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HECTD3Q5T447 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HECTD3Q5T447 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HECTD3Q5T447 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HECTD3Q5T447 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HECTD3Q5T447 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HECTD3Q5T447 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HECTD3Q5T447 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HECTD3Q5T447 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HECTD3Q5T447 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HECTD3Q5T447 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HECTD3Q5T447 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HECTD3Q5T447 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HECTD3Q5T447 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HECTD3Q5T447 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HECTD3Q5T447 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HECTD3Q5T447 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HECTD3Q5T447 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HECTD3Q5T447 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HECTD3Q5T447 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HECTD3Q5T447 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HECTD3Q5T447 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HECTD3Q5T447 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HECTD3Q5T447 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HECTD3Q5T447 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HECTD3Q5T447 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HECTD3Q5T447 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HECTD3Q5T447 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HECTD3Q5T447 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HECTD3Q5T447 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HECTD3Q5T447 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HECTD3Q5T447 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HECTD3Q5T447 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HECTD3Q5T447 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HECTD3Q5T447 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HECTD3Q5T447 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HECTD3Q5T447 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HECTD3Q5T447 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HECTD3Q5T447 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HECTD3Q5T447 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HECTD3Q5T447 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HECTD3Q5T447 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HECTD3Q5T447 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HECTD3Q5T447 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HECTD3Q5T447 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HECTD3Q5T447 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HECTD3Q5T447 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HECTD3Q5T447 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HECTD3Q5T447 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HECTD3Q5T447 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HECTD3Q5T447 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HECTD3Q5T447 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HECTD3Q5T447 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HECTD3Q5T447 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HECTD3Q5T447 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HECTD3Q5T447 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HECTD3Q5T447 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HECTD3Q5T447 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HECTD3Q5T447 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HECTD3Q5T447 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HECTD3Q5T447 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HECTD3Q5T447 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HECTD3Q5T447 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HECTD3Q5T447 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HECTD3Q5T447 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HECTD3Q5T447 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HECTD3Q5T447 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms