Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
FRMPD1Q5SYB0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
FRMPD1Q5SYB0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC35.5■■■■□ 3.27
FRMPD1Q5SYB0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC35.49■■■■□ 3.27
FRMPD1Q5SYB0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
FRMPD1Q5SYB0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
FRMPD1Q5SYB0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
FRMPD1Q5SYB0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
FRMPD1Q5SYB0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
FRMPD1Q5SYB0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
FRMPD1Q5SYB0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
FRMPD1Q5SYB0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
FRMPD1Q5SYB0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
FRMPD1Q5SYB0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
FRMPD1Q5SYB0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
FRMPD1Q5SYB0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
FRMPD1Q5SYB0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
FRMPD1Q5SYB0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
FRMPD1Q5SYB0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
FRMPD1Q5SYB0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
FRMPD1Q5SYB0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
FRMPD1Q5SYB0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC35.45■■■■□ 3.27
FRMPD1Q5SYB0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
FRMPD1Q5SYB0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.26
FRMPD1Q5SYB0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
FRMPD1Q5SYB0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
FRMPD1Q5SYB0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
FRMPD1Q5SYB0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
FRMPD1Q5SYB0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
FRMPD1Q5SYB0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
FRMPD1Q5SYB0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
FRMPD1Q5SYB0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
FRMPD1Q5SYB0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
FRMPD1Q5SYB0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
FRMPD1Q5SYB0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
FRMPD1Q5SYB0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
FRMPD1Q5SYB0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
FRMPD1Q5SYB0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
FRMPD1Q5SYB0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
FRMPD1Q5SYB0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
FRMPD1Q5SYB0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
FRMPD1Q5SYB0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
FRMPD1Q5SYB0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
FRMPD1Q5SYB0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
FRMPD1Q5SYB0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
FRMPD1Q5SYB0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
FRMPD1Q5SYB0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
FRMPD1Q5SYB0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
FRMPD1Q5SYB0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
FRMPD1Q5SYB0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
FRMPD1Q5SYB0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
FRMPD1Q5SYB0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
FRMPD1Q5SYB0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
FRMPD1Q5SYB0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC35.42■■■■□ 3.26
FRMPD1Q5SYB0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
FRMPD1Q5SYB0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
FRMPD1Q5SYB0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
FRMPD1Q5SYB0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
FRMPD1Q5SYB0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
FRMPD1Q5SYB0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
FRMPD1Q5SYB0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
FRMPD1Q5SYB0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
FRMPD1Q5SYB0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
FRMPD1Q5SYB0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
FRMPD1Q5SYB0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
FRMPD1Q5SYB0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
FRMPD1Q5SYB0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
FRMPD1Q5SYB0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
FRMPD1Q5SYB0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
FRMPD1Q5SYB0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
FRMPD1Q5SYB0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
FRMPD1Q5SYB0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
FRMPD1Q5SYB0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
FRMPD1Q5SYB0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
FRMPD1Q5SYB0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
FRMPD1Q5SYB0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
FRMPD1Q5SYB0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
FRMPD1Q5SYB0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
FRMPD1Q5SYB0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
FRMPD1Q5SYB0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
FRMPD1Q5SYB0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
FRMPD1Q5SYB0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
FRMPD1Q5SYB0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
FRMPD1Q5SYB0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
FRMPD1Q5SYB0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
FRMPD1Q5SYB0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.35■■■■□ 3.25
FRMPD1Q5SYB0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
FRMPD1Q5SYB0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
FRMPD1Q5SYB0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
FRMPD1Q5SYB0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
FRMPD1Q5SYB0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
FRMPD1Q5SYB0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC35.34■■■■□ 3.25
FRMPD1Q5SYB0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
FRMPD1Q5SYB0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
FRMPD1Q5SYB0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
FRMPD1Q5SYB0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
FRMPD1Q5SYB0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
FRMPD1Q5SYB0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
FRMPD1Q5SYB0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
FRMPD1Q5SYB0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms