Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHYHD1Q5SRE7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHYHD1Q5SRE7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHYHD1Q5SRE7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHYHD1Q5SRE7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PHYHD1Q5SRE7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PHYHD1Q5SRE7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PHYHD1Q5SRE7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PHYHD1Q5SRE7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PHYHD1Q5SRE7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PHYHD1Q5SRE7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PHYHD1Q5SRE7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PHYHD1Q5SRE7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PHYHD1Q5SRE7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PHYHD1Q5SRE7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PHYHD1Q5SRE7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PHYHD1Q5SRE7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PHYHD1Q5SRE7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PHYHD1Q5SRE7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PHYHD1Q5SRE7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PHYHD1Q5SRE7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PHYHD1Q5SRE7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PHYHD1Q5SRE7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PHYHD1Q5SRE7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PHYHD1Q5SRE7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PHYHD1Q5SRE7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PHYHD1Q5SRE7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PHYHD1Q5SRE7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PHYHD1Q5SRE7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PHYHD1Q5SRE7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PHYHD1Q5SRE7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PHYHD1Q5SRE7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PHYHD1Q5SRE7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PHYHD1Q5SRE7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PHYHD1Q5SRE7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PHYHD1Q5SRE7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PHYHD1Q5SRE7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PHYHD1Q5SRE7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PHYHD1Q5SRE7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PHYHD1Q5SRE7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PHYHD1Q5SRE7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PHYHD1Q5SRE7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PHYHD1Q5SRE7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PHYHD1Q5SRE7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PHYHD1Q5SRE7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PHYHD1Q5SRE7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PHYHD1Q5SRE7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PHYHD1Q5SRE7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PHYHD1Q5SRE7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PHYHD1Q5SRE7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PHYHD1Q5SRE7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PHYHD1Q5SRE7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PHYHD1Q5SRE7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PHYHD1Q5SRE7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PHYHD1Q5SRE7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PHYHD1Q5SRE7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PHYHD1Q5SRE7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PHYHD1Q5SRE7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PHYHD1Q5SRE7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PHYHD1Q5SRE7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PHYHD1Q5SRE7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PHYHD1Q5SRE7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PHYHD1Q5SRE7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PHYHD1Q5SRE7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHYHD1Q5SRE7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHYHD1Q5SRE7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHYHD1Q5SRE7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PHYHD1Q5SRE7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHYHD1Q5SRE7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHYHD1Q5SRE7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHYHD1Q5SRE7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PHYHD1Q5SRE7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PHYHD1Q5SRE7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PHYHD1Q5SRE7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PHYHD1Q5SRE7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHYHD1Q5SRE7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHYHD1Q5SRE7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHYHD1Q5SRE7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHYHD1Q5SRE7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHYHD1Q5SRE7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHYHD1Q5SRE7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHYHD1Q5SRE7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHYHD1Q5SRE7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHYHD1Q5SRE7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHYHD1Q5SRE7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PHYHD1Q5SRE7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHYHD1Q5SRE7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PHYHD1Q5SRE7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHYHD1Q5SRE7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHYHD1Q5SRE7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHYHD1Q5SRE7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHYHD1Q5SRE7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHYHD1Q5SRE7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHYHD1Q5SRE7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHYHD1Q5SRE7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHYHD1Q5SRE7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHYHD1Q5SRE7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHYHD1Q5SRE7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHYHD1Q5SRE7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHYHD1Q5SRE7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms