Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NUP188Q5SRE5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
NUP188Q5SRE5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NUP188Q5SRE5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NUP188Q5SRE5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NUP188Q5SRE5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NUP188Q5SRE5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NUP188Q5SRE5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NUP188Q5SRE5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NUP188Q5SRE5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NUP188Q5SRE5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NUP188Q5SRE5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NUP188Q5SRE5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NUP188Q5SRE5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NUP188Q5SRE5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NUP188Q5SRE5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NUP188Q5SRE5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NUP188Q5SRE5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NUP188Q5SRE5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
NUP188Q5SRE5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NUP188Q5SRE5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NUP188Q5SRE5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
NUP188Q5SRE5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
NUP188Q5SRE5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NUP188Q5SRE5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
NUP188Q5SRE5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
NUP188Q5SRE5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
NUP188Q5SRE5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
NUP188Q5SRE5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NUP188Q5SRE5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NUP188Q5SRE5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NUP188Q5SRE5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NUP188Q5SRE5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
NUP188Q5SRE5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NUP188Q5SRE5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NUP188Q5SRE5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NUP188Q5SRE5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NUP188Q5SRE5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NUP188Q5SRE5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NUP188Q5SRE5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NUP188Q5SRE5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NUP188Q5SRE5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NUP188Q5SRE5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NUP188Q5SRE5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
NUP188Q5SRE5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NUP188Q5SRE5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NUP188Q5SRE5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NUP188Q5SRE5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NUP188Q5SRE5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NUP188Q5SRE5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NUP188Q5SRE5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NUP188Q5SRE5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NUP188Q5SRE5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NUP188Q5SRE5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NUP188Q5SRE5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
NUP188Q5SRE5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NUP188Q5SRE5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NUP188Q5SRE5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
NUP188Q5SRE5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NUP188Q5SRE5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NUP188Q5SRE5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NUP188Q5SRE5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NUP188Q5SRE5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NUP188Q5SRE5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NUP188Q5SRE5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NUP188Q5SRE5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NUP188Q5SRE5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NUP188Q5SRE5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NUP188Q5SRE5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NUP188Q5SRE5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NUP188Q5SRE5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NUP188Q5SRE5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NUP188Q5SRE5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NUP188Q5SRE5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
NUP188Q5SRE5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NUP188Q5SRE5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NUP188Q5SRE5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NUP188Q5SRE5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NUP188Q5SRE5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NUP188Q5SRE5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NUP188Q5SRE5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NUP188Q5SRE5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NUP188Q5SRE5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NUP188Q5SRE5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NUP188Q5SRE5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NUP188Q5SRE5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NUP188Q5SRE5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NUP188Q5SRE5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NUP188Q5SRE5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NUP188Q5SRE5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NUP188Q5SRE5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NUP188Q5SRE5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
NUP188Q5SRE5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NUP188Q5SRE5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NUP188Q5SRE5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NUP188Q5SRE5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NUP188Q5SRE5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NUP188Q5SRE5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NUP188Q5SRE5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NUP188Q5SRE5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms