Protein–RNA interactions for Protein: Q5SR53

PIK3CD-AS1, Putative uncharacterized protein PIK3CD-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CD-AS1Q5SR53 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIK3CD-AS1Q5SR53 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIK3CD-AS1Q5SR53 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIK3CD-AS1Q5SR53 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIK3CD-AS1Q5SR53 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIK3CD-AS1Q5SR53 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIK3CD-AS1Q5SR53 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIK3CD-AS1Q5SR53 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIK3CD-AS1Q5SR53 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PIK3CD-AS1Q5SR53 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PIK3CD-AS1Q5SR53 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PIK3CD-AS1Q5SR53 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PIK3CD-AS1Q5SR53 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PIK3CD-AS1Q5SR53 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PIK3CD-AS1Q5SR53 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PIK3CD-AS1Q5SR53 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PIK3CD-AS1Q5SR53 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PIK3CD-AS1Q5SR53 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PIK3CD-AS1Q5SR53 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PIK3CD-AS1Q5SR53 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PIK3CD-AS1Q5SR53 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PIK3CD-AS1Q5SR53 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PIK3CD-AS1Q5SR53 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PIK3CD-AS1Q5SR53 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PIK3CD-AS1Q5SR53 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PIK3CD-AS1Q5SR53 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PIK3CD-AS1Q5SR53 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PIK3CD-AS1Q5SR53 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PIK3CD-AS1Q5SR53 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PIK3CD-AS1Q5SR53 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PIK3CD-AS1Q5SR53 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PIK3CD-AS1Q5SR53 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PIK3CD-AS1Q5SR53 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PIK3CD-AS1Q5SR53 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PIK3CD-AS1Q5SR53 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PIK3CD-AS1Q5SR53 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PIK3CD-AS1Q5SR53 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PIK3CD-AS1Q5SR53 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PIK3CD-AS1Q5SR53 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3CD-AS1Q5SR53 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3CD-AS1Q5SR53 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3CD-AS1Q5SR53 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3CD-AS1Q5SR53 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3CD-AS1Q5SR53 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3CD-AS1Q5SR53 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PIK3CD-AS1Q5SR53 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PIK3CD-AS1Q5SR53 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PIK3CD-AS1Q5SR53 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PIK3CD-AS1Q5SR53 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PIK3CD-AS1Q5SR53 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PIK3CD-AS1Q5SR53 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms