Protein–RNA interactions for Protein: Q5R3I4

TTC38, Tetratricopeptide repeat protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC38Q5R3I4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTC38Q5R3I4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTC38Q5R3I4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTC38Q5R3I4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTC38Q5R3I4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TTC38Q5R3I4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TTC38Q5R3I4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TTC38Q5R3I4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TTC38Q5R3I4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TTC38Q5R3I4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TTC38Q5R3I4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTC38Q5R3I4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTC38Q5R3I4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTC38Q5R3I4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTC38Q5R3I4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTC38Q5R3I4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTC38Q5R3I4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTC38Q5R3I4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTC38Q5R3I4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTC38Q5R3I4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTC38Q5R3I4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TTC38Q5R3I4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TTC38Q5R3I4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TTC38Q5R3I4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TTC38Q5R3I4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TTC38Q5R3I4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TTC38Q5R3I4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TTC38Q5R3I4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TTC38Q5R3I4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TTC38Q5R3I4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TTC38Q5R3I4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TTC38Q5R3I4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TTC38Q5R3I4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TTC38Q5R3I4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TTC38Q5R3I4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TTC38Q5R3I4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TTC38Q5R3I4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TTC38Q5R3I4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TTC38Q5R3I4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TTC38Q5R3I4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TTC38Q5R3I4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TTC38Q5R3I4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TTC38Q5R3I4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TTC38Q5R3I4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TTC38Q5R3I4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TTC38Q5R3I4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TTC38Q5R3I4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TTC38Q5R3I4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TTC38Q5R3I4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TTC38Q5R3I4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TTC38Q5R3I4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TTC38Q5R3I4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TTC38Q5R3I4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TTC38Q5R3I4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TTC38Q5R3I4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TTC38Q5R3I4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TTC38Q5R3I4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TTC38Q5R3I4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TTC38Q5R3I4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TTC38Q5R3I4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TTC38Q5R3I4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TTC38Q5R3I4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TTC38Q5R3I4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TTC38Q5R3I4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TTC38Q5R3I4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TTC38Q5R3I4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TTC38Q5R3I4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TTC38Q5R3I4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TTC38Q5R3I4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TTC38Q5R3I4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TTC38Q5R3I4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TTC38Q5R3I4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TTC38Q5R3I4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TTC38Q5R3I4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TTC38Q5R3I4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TTC38Q5R3I4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TTC38Q5R3I4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TTC38Q5R3I4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TTC38Q5R3I4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TTC38Q5R3I4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TTC38Q5R3I4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TTC38Q5R3I4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TTC38Q5R3I4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TTC38Q5R3I4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TTC38Q5R3I4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTC38Q5R3I4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTC38Q5R3I4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTC38Q5R3I4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTC38Q5R3I4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTC38Q5R3I4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTC38Q5R3I4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTC38Q5R3I4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTC38Q5R3I4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTC38Q5R3I4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTC38Q5R3I4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TTC38Q5R3I4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TTC38Q5R3I4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TTC38Q5R3I4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TTC38Q5R3I4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TTC38Q5R3I4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms