Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PITRM1Q5JRX3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PITRM1Q5JRX3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PITRM1Q5JRX3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PITRM1Q5JRX3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PITRM1Q5JRX3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PITRM1Q5JRX3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PITRM1Q5JRX3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PITRM1Q5JRX3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PITRM1Q5JRX3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PITRM1Q5JRX3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PITRM1Q5JRX3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PITRM1Q5JRX3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PITRM1Q5JRX3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PITRM1Q5JRX3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PITRM1Q5JRX3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PITRM1Q5JRX3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PITRM1Q5JRX3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PITRM1Q5JRX3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PITRM1Q5JRX3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PITRM1Q5JRX3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PITRM1Q5JRX3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PITRM1Q5JRX3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PITRM1Q5JRX3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PITRM1Q5JRX3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PITRM1Q5JRX3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PITRM1Q5JRX3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PITRM1Q5JRX3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PITRM1Q5JRX3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PITRM1Q5JRX3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PITRM1Q5JRX3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PITRM1Q5JRX3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PITRM1Q5JRX3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PITRM1Q5JRX3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PITRM1Q5JRX3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PITRM1Q5JRX3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PITRM1Q5JRX3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PITRM1Q5JRX3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PITRM1Q5JRX3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PITRM1Q5JRX3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PITRM1Q5JRX3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PITRM1Q5JRX3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PITRM1Q5JRX3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PITRM1Q5JRX3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PITRM1Q5JRX3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PITRM1Q5JRX3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PITRM1Q5JRX3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PITRM1Q5JRX3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PITRM1Q5JRX3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PITRM1Q5JRX3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PITRM1Q5JRX3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PITRM1Q5JRX3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PITRM1Q5JRX3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PITRM1Q5JRX3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PITRM1Q5JRX3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PITRM1Q5JRX3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PITRM1Q5JRX3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PITRM1Q5JRX3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PITRM1Q5JRX3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PITRM1Q5JRX3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PITRM1Q5JRX3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PITRM1Q5JRX3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PITRM1Q5JRX3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PITRM1Q5JRX3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PITRM1Q5JRX3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PITRM1Q5JRX3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PITRM1Q5JRX3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PITRM1Q5JRX3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PITRM1Q5JRX3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PITRM1Q5JRX3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PITRM1Q5JRX3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PITRM1Q5JRX3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PITRM1Q5JRX3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PITRM1Q5JRX3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PITRM1Q5JRX3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PITRM1Q5JRX3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PITRM1Q5JRX3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PITRM1Q5JRX3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PITRM1Q5JRX3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PITRM1Q5JRX3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PITRM1Q5JRX3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PITRM1Q5JRX3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PITRM1Q5JRX3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PITRM1Q5JRX3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PITRM1Q5JRX3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PITRM1Q5JRX3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PITRM1Q5JRX3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PITRM1Q5JRX3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PITRM1Q5JRX3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PITRM1Q5JRX3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PITRM1Q5JRX3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PITRM1Q5JRX3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PITRM1Q5JRX3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PITRM1Q5JRX3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PITRM1Q5JRX3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PITRM1Q5JRX3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PITRM1Q5JRX3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PITRM1Q5JRX3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PITRM1Q5JRX3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PITRM1Q5JRX3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
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