Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJD5

TMEM41B, Transmembrane protein 41B, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM41BQ5BJD5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM41BQ5BJD5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM41BQ5BJD5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM41BQ5BJD5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM41BQ5BJD5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM41BQ5BJD5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM41BQ5BJD5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM41BQ5BJD5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM41BQ5BJD5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM41BQ5BJD5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM41BQ5BJD5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM41BQ5BJD5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM41BQ5BJD5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM41BQ5BJD5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM41BQ5BJD5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM41BQ5BJD5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM41BQ5BJD5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM41BQ5BJD5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM41BQ5BJD5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM41BQ5BJD5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM41BQ5BJD5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM41BQ5BJD5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM41BQ5BJD5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM41BQ5BJD5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM41BQ5BJD5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM41BQ5BJD5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM41BQ5BJD5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM41BQ5BJD5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM41BQ5BJD5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM41BQ5BJD5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM41BQ5BJD5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM41BQ5BJD5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM41BQ5BJD5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM41BQ5BJD5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM41BQ5BJD5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM41BQ5BJD5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM41BQ5BJD5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM41BQ5BJD5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM41BQ5BJD5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM41BQ5BJD5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM41BQ5BJD5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM41BQ5BJD5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM41BQ5BJD5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM41BQ5BJD5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM41BQ5BJD5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM41BQ5BJD5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM41BQ5BJD5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM41BQ5BJD5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM41BQ5BJD5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM41BQ5BJD5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM41BQ5BJD5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM41BQ5BJD5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM41BQ5BJD5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM41BQ5BJD5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM41BQ5BJD5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM41BQ5BJD5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM41BQ5BJD5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM41BQ5BJD5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM41BQ5BJD5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM41BQ5BJD5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM41BQ5BJD5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM41BQ5BJD5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM41BQ5BJD5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM41BQ5BJD5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM41BQ5BJD5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms