Protein–RNA interactions for Protein: Q58FG1

HSP90AA4P, Putative heat shock protein HSP 90-alpha A4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AA4PQ58FG1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HSP90AA4PQ58FG1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HSP90AA4PQ58FG1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HSP90AA4PQ58FG1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HSP90AA4PQ58FG1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HSP90AA4PQ58FG1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HSP90AA4PQ58FG1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HSP90AA4PQ58FG1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HSP90AA4PQ58FG1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HSP90AA4PQ58FG1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HSP90AA4PQ58FG1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HSP90AA4PQ58FG1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HSP90AA4PQ58FG1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HSP90AA4PQ58FG1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HSP90AA4PQ58FG1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HSP90AA4PQ58FG1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HSP90AA4PQ58FG1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HSP90AA4PQ58FG1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HSP90AA4PQ58FG1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HSP90AA4PQ58FG1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HSP90AA4PQ58FG1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
HSP90AA4PQ58FG1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HSP90AA4PQ58FG1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
HSP90AA4PQ58FG1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HSP90AA4PQ58FG1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HSP90AA4PQ58FG1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HSP90AA4PQ58FG1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HSP90AA4PQ58FG1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HSP90AA4PQ58FG1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HSP90AA4PQ58FG1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HSP90AA4PQ58FG1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HSP90AA4PQ58FG1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HSP90AA4PQ58FG1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HSP90AA4PQ58FG1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HSP90AA4PQ58FG1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HSP90AA4PQ58FG1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HSP90AA4PQ58FG1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HSP90AA4PQ58FG1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HSP90AA4PQ58FG1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HSP90AA4PQ58FG1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HSP90AA4PQ58FG1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HSP90AA4PQ58FG1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HSP90AA4PQ58FG1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HSP90AA4PQ58FG1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HSP90AA4PQ58FG1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HSP90AA4PQ58FG1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HSP90AA4PQ58FG1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HSP90AA4PQ58FG1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HSP90AA4PQ58FG1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HSP90AA4PQ58FG1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HSP90AA4PQ58FG1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HSP90AA4PQ58FG1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HSP90AA4PQ58FG1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HSP90AA4PQ58FG1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HSP90AA4PQ58FG1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HSP90AA4PQ58FG1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HSP90AA4PQ58FG1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HSP90AA4PQ58FG1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HSP90AA4PQ58FG1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HSP90AA4PQ58FG1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HSP90AA4PQ58FG1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HSP90AA4PQ58FG1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HSP90AA4PQ58FG1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HSP90AA4PQ58FG1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HSP90AA4PQ58FG1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HSP90AA4PQ58FG1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HSP90AA4PQ58FG1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
HSP90AA4PQ58FG1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HSP90AA4PQ58FG1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HSP90AA4PQ58FG1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HSP90AA4PQ58FG1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HSP90AA4PQ58FG1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HSP90AA4PQ58FG1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HSP90AA4PQ58FG1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HSP90AA4PQ58FG1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HSP90AA4PQ58FG1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HSP90AA4PQ58FG1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
HSP90AA4PQ58FG1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HSP90AA4PQ58FG1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HSP90AA4PQ58FG1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HSP90AA4PQ58FG1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HSP90AA4PQ58FG1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HSP90AA4PQ58FG1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HSP90AA4PQ58FG1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HSP90AA4PQ58FG1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HSP90AA4PQ58FG1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HSP90AA4PQ58FG1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HSP90AA4PQ58FG1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HSP90AA4PQ58FG1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HSP90AA4PQ58FG1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HSP90AA4PQ58FG1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
HSP90AA4PQ58FG1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HSP90AA4PQ58FG1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HSP90AA4PQ58FG1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HSP90AA4PQ58FG1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HSP90AA4PQ58FG1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HSP90AA4PQ58FG1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HSP90AA4PQ58FG1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HSP90AA4PQ58FG1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HSP90AA4PQ58FG1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms