Protein–RNA interactions for Protein: Q56A73

SPIN4, Spindlin-4, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN4Q56A73 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPIN4Q56A73 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPIN4Q56A73 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPIN4Q56A73 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPIN4Q56A73 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPIN4Q56A73 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPIN4Q56A73 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPIN4Q56A73 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPIN4Q56A73 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPIN4Q56A73 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPIN4Q56A73 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPIN4Q56A73 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPIN4Q56A73 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPIN4Q56A73 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPIN4Q56A73 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPIN4Q56A73 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPIN4Q56A73 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPIN4Q56A73 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SPIN4Q56A73 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SPIN4Q56A73 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPIN4Q56A73 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPIN4Q56A73 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPIN4Q56A73 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPIN4Q56A73 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPIN4Q56A73 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPIN4Q56A73 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPIN4Q56A73 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPIN4Q56A73 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPIN4Q56A73 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SPIN4Q56A73 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPIN4Q56A73 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPIN4Q56A73 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPIN4Q56A73 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPIN4Q56A73 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPIN4Q56A73 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPIN4Q56A73 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPIN4Q56A73 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPIN4Q56A73 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPIN4Q56A73 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPIN4Q56A73 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPIN4Q56A73 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPIN4Q56A73 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPIN4Q56A73 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPIN4Q56A73 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPIN4Q56A73 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPIN4Q56A73 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPIN4Q56A73 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPIN4Q56A73 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPIN4Q56A73 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPIN4Q56A73 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPIN4Q56A73 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPIN4Q56A73 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPIN4Q56A73 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPIN4Q56A73 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPIN4Q56A73 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPIN4Q56A73 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPIN4Q56A73 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPIN4Q56A73 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPIN4Q56A73 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SPIN4Q56A73 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPIN4Q56A73 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPIN4Q56A73 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SPIN4Q56A73 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPIN4Q56A73 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SPIN4Q56A73 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPIN4Q56A73 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPIN4Q56A73 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPIN4Q56A73 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPIN4Q56A73 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms