Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB6CQ53S08 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB6CQ53S08 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB6CQ53S08 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB6CQ53S08 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB6CQ53S08 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB6CQ53S08 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB6CQ53S08 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB6CQ53S08 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB6CQ53S08 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB6CQ53S08 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB6CQ53S08 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB6CQ53S08 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB6CQ53S08 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB6CQ53S08 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB6CQ53S08 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB6CQ53S08 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB6CQ53S08 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB6CQ53S08 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB6CQ53S08 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB6CQ53S08 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB6CQ53S08 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB6CQ53S08 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB6CQ53S08 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB6CQ53S08 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB6CQ53S08 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB6CQ53S08 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB6CQ53S08 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB6CQ53S08 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB6CQ53S08 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB6CQ53S08 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB6CQ53S08 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB6CQ53S08 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB6CQ53S08 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB6CQ53S08 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB6CQ53S08 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB6CQ53S08 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB6CQ53S08 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB6CQ53S08 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB6CQ53S08 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB6CQ53S08 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB6CQ53S08 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB6CQ53S08 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB6CQ53S08 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB6CQ53S08 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB6CQ53S08 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB6CQ53S08 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB6CQ53S08 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB6CQ53S08 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB6CQ53S08 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB6CQ53S08 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB6CQ53S08 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB6CQ53S08 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB6CQ53S08 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB6CQ53S08 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB6CQ53S08 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB6CQ53S08 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB6CQ53S08 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB6CQ53S08 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB6CQ53S08 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB6CQ53S08 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB6CQ53S08 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB6CQ53S08 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB6CQ53S08 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB6CQ53S08 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB6CQ53S08 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB6CQ53S08 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB6CQ53S08 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB6CQ53S08 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB6CQ53S08 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB6CQ53S08 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB6CQ53S08 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB6CQ53S08 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB6CQ53S08 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB6CQ53S08 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB6CQ53S08 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB6CQ53S08 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB6CQ53S08 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB6CQ53S08 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB6CQ53S08 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB6CQ53S08 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB6CQ53S08 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB6CQ53S08 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB6CQ53S08 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB6CQ53S08 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB6CQ53S08 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB6CQ53S08 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB6CQ53S08 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB6CQ53S08 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB6CQ53S08 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB6CQ53S08 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB6CQ53S08 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB6CQ53S08 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB6CQ53S08 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB6CQ53S08 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB6CQ53S08 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB6CQ53S08 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB6CQ53S08 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB6CQ53S08 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB6CQ53S08 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 2134.7 ms