Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL12Q53G59 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL12Q53G59 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL12Q53G59 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL12Q53G59 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL12Q53G59 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
KLHL12Q53G59 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL12Q53G59 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL12Q53G59 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL12Q53G59 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL12Q53G59 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL12Q53G59 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL12Q53G59 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL12Q53G59 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL12Q53G59 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL12Q53G59 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL12Q53G59 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL12Q53G59 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL12Q53G59 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL12Q53G59 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL12Q53G59 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL12Q53G59 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL12Q53G59 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL12Q53G59 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL12Q53G59 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL12Q53G59 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL12Q53G59 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL12Q53G59 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL12Q53G59 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL12Q53G59 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL12Q53G59 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL12Q53G59 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL12Q53G59 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL12Q53G59 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms