Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFTN2Q52LD8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFTN2Q52LD8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFTN2Q52LD8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFTN2Q52LD8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFTN2Q52LD8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFTN2Q52LD8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFTN2Q52LD8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFTN2Q52LD8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFTN2Q52LD8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RFTN2Q52LD8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFTN2Q52LD8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFTN2Q52LD8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFTN2Q52LD8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFTN2Q52LD8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFTN2Q52LD8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFTN2Q52LD8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFTN2Q52LD8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFTN2Q52LD8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFTN2Q52LD8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFTN2Q52LD8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RFTN2Q52LD8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFTN2Q52LD8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFTN2Q52LD8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFTN2Q52LD8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFTN2Q52LD8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFTN2Q52LD8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFTN2Q52LD8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFTN2Q52LD8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFTN2Q52LD8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFTN2Q52LD8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFTN2Q52LD8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFTN2Q52LD8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFTN2Q52LD8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFTN2Q52LD8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFTN2Q52LD8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFTN2Q52LD8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFTN2Q52LD8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFTN2Q52LD8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.3 ms