Protein–RNA interactions for Protein: Q502W6

VWA3B, von Willebrand factor A domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3BQ502W6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VWA3BQ502W6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VWA3BQ502W6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VWA3BQ502W6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VWA3BQ502W6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
VWA3BQ502W6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VWA3BQ502W6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VWA3BQ502W6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VWA3BQ502W6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VWA3BQ502W6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VWA3BQ502W6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VWA3BQ502W6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VWA3BQ502W6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VWA3BQ502W6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VWA3BQ502W6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VWA3BQ502W6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VWA3BQ502W6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VWA3BQ502W6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VWA3BQ502W6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VWA3BQ502W6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VWA3BQ502W6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VWA3BQ502W6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VWA3BQ502W6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VWA3BQ502W6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VWA3BQ502W6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VWA3BQ502W6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VWA3BQ502W6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VWA3BQ502W6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VWA3BQ502W6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VWA3BQ502W6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
VWA3BQ502W6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VWA3BQ502W6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VWA3BQ502W6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VWA3BQ502W6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VWA3BQ502W6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VWA3BQ502W6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VWA3BQ502W6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VWA3BQ502W6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VWA3BQ502W6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VWA3BQ502W6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VWA3BQ502W6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VWA3BQ502W6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VWA3BQ502W6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VWA3BQ502W6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VWA3BQ502W6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
VWA3BQ502W6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VWA3BQ502W6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
VWA3BQ502W6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VWA3BQ502W6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VWA3BQ502W6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VWA3BQ502W6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VWA3BQ502W6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VWA3BQ502W6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VWA3BQ502W6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VWA3BQ502W6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VWA3BQ502W6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VWA3BQ502W6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VWA3BQ502W6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VWA3BQ502W6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VWA3BQ502W6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VWA3BQ502W6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VWA3BQ502W6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VWA3BQ502W6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VWA3BQ502W6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
VWA3BQ502W6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
VWA3BQ502W6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
VWA3BQ502W6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VWA3BQ502W6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VWA3BQ502W6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VWA3BQ502W6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VWA3BQ502W6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VWA3BQ502W6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VWA3BQ502W6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VWA3BQ502W6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VWA3BQ502W6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VWA3BQ502W6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VWA3BQ502W6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VWA3BQ502W6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VWA3BQ502W6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VWA3BQ502W6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VWA3BQ502W6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VWA3BQ502W6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VWA3BQ502W6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VWA3BQ502W6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VWA3BQ502W6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VWA3BQ502W6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VWA3BQ502W6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VWA3BQ502W6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VWA3BQ502W6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VWA3BQ502W6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VWA3BQ502W6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VWA3BQ502W6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VWA3BQ502W6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VWA3BQ502W6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VWA3BQ502W6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VWA3BQ502W6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VWA3BQ502W6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VWA3BQ502W6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VWA3BQ502W6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VWA3BQ502W6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms