Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM259Q4ZIN3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM259Q4ZIN3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM259Q4ZIN3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM259Q4ZIN3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM259Q4ZIN3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM259Q4ZIN3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM259Q4ZIN3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM259Q4ZIN3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM259Q4ZIN3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM259Q4ZIN3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM259Q4ZIN3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM259Q4ZIN3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM259Q4ZIN3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM259Q4ZIN3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM259Q4ZIN3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM259Q4ZIN3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM259Q4ZIN3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM259Q4ZIN3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM259Q4ZIN3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM259Q4ZIN3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM259Q4ZIN3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM259Q4ZIN3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM259Q4ZIN3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM259Q4ZIN3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM259Q4ZIN3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM259Q4ZIN3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM259Q4ZIN3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM259Q4ZIN3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM259Q4ZIN3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM259Q4ZIN3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM259Q4ZIN3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM259Q4ZIN3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM259Q4ZIN3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM259Q4ZIN3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM259Q4ZIN3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM259Q4ZIN3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM259Q4ZIN3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM259Q4ZIN3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM259Q4ZIN3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM259Q4ZIN3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM259Q4ZIN3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM259Q4ZIN3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM259Q4ZIN3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM259Q4ZIN3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM259Q4ZIN3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM259Q4ZIN3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM259Q4ZIN3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM259Q4ZIN3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM259Q4ZIN3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM259Q4ZIN3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM259Q4ZIN3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM259Q4ZIN3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM259Q4ZIN3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM259Q4ZIN3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM259Q4ZIN3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM259Q4ZIN3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM259Q4ZIN3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM259Q4ZIN3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM259Q4ZIN3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM259Q4ZIN3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM259Q4ZIN3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM259Q4ZIN3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM259Q4ZIN3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM259Q4ZIN3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM259Q4ZIN3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM259Q4ZIN3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM259Q4ZIN3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM259Q4ZIN3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM259Q4ZIN3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM259Q4ZIN3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM259Q4ZIN3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM259Q4ZIN3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM259Q4ZIN3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM259Q4ZIN3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM259Q4ZIN3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM259Q4ZIN3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM259Q4ZIN3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM259Q4ZIN3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM259Q4ZIN3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM259Q4ZIN3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM259Q4ZIN3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM259Q4ZIN3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM259Q4ZIN3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM259Q4ZIN3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM259Q4ZIN3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM259Q4ZIN3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM259Q4ZIN3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM259Q4ZIN3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM259Q4ZIN3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM259Q4ZIN3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM259Q4ZIN3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM259Q4ZIN3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM259Q4ZIN3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM259Q4ZIN3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM259Q4ZIN3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM259Q4ZIN3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM259Q4ZIN3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM259Q4ZIN3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM259Q4ZIN3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms