Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXU2

PABPC1L, Polyadenylate-binding protein 1-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1LQ4VXU2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PABPC1LQ4VXU2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PABPC1LQ4VXU2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PABPC1LQ4VXU2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PABPC1LQ4VXU2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PABPC1LQ4VXU2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PABPC1LQ4VXU2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PABPC1LQ4VXU2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PABPC1LQ4VXU2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PABPC1LQ4VXU2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PABPC1LQ4VXU2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PABPC1LQ4VXU2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PABPC1LQ4VXU2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PABPC1LQ4VXU2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PABPC1LQ4VXU2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PABPC1LQ4VXU2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PABPC1LQ4VXU2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PABPC1LQ4VXU2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PABPC1LQ4VXU2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PABPC1LQ4VXU2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PABPC1LQ4VXU2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PABPC1LQ4VXU2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PABPC1LQ4VXU2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PABPC1LQ4VXU2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PABPC1LQ4VXU2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PABPC1LQ4VXU2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PABPC1LQ4VXU2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PABPC1LQ4VXU2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PABPC1LQ4VXU2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PABPC1LQ4VXU2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PABPC1LQ4VXU2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PABPC1LQ4VXU2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PABPC1LQ4VXU2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PABPC1LQ4VXU2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PABPC1LQ4VXU2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PABPC1LQ4VXU2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PABPC1LQ4VXU2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PABPC1LQ4VXU2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PABPC1LQ4VXU2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PABPC1LQ4VXU2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PABPC1LQ4VXU2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PABPC1LQ4VXU2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PABPC1LQ4VXU2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PABPC1LQ4VXU2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PABPC1LQ4VXU2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PABPC1LQ4VXU2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PABPC1LQ4VXU2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PABPC1LQ4VXU2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PABPC1LQ4VXU2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PABPC1LQ4VXU2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PABPC1LQ4VXU2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PABPC1LQ4VXU2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PABPC1LQ4VXU2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PABPC1LQ4VXU2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PABPC1LQ4VXU2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PABPC1LQ4VXU2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PABPC1LQ4VXU2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PABPC1LQ4VXU2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PABPC1LQ4VXU2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PABPC1LQ4VXU2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PABPC1LQ4VXU2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PABPC1LQ4VXU2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PABPC1LQ4VXU2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PABPC1LQ4VXU2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PABPC1LQ4VXU2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PABPC1LQ4VXU2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PABPC1LQ4VXU2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PABPC1LQ4VXU2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PABPC1LQ4VXU2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PABPC1LQ4VXU2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PABPC1LQ4VXU2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PABPC1LQ4VXU2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PABPC1LQ4VXU2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PABPC1LQ4VXU2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PABPC1LQ4VXU2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PABPC1LQ4VXU2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PABPC1LQ4VXU2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PABPC1LQ4VXU2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PABPC1LQ4VXU2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PABPC1LQ4VXU2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PABPC1LQ4VXU2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PABPC1LQ4VXU2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PABPC1LQ4VXU2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PABPC1LQ4VXU2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PABPC1LQ4VXU2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PABPC1LQ4VXU2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PABPC1LQ4VXU2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PABPC1LQ4VXU2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PABPC1LQ4VXU2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PABPC1LQ4VXU2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PABPC1LQ4VXU2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PABPC1LQ4VXU2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PABPC1LQ4VXU2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PABPC1LQ4VXU2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PABPC1LQ4VXU2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PABPC1LQ4VXU2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PABPC1LQ4VXU2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PABPC1LQ4VXU2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PABPC1LQ4VXU2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PABPC1LQ4VXU2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms