Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DUSP28Q4G0W2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DUSP28Q4G0W2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DUSP28Q4G0W2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DUSP28Q4G0W2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DUSP28Q4G0W2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
DUSP28Q4G0W2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DUSP28Q4G0W2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
DUSP28Q4G0W2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DUSP28Q4G0W2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DUSP28Q4G0W2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DUSP28Q4G0W2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DUSP28Q4G0W2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DUSP28Q4G0W2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DUSP28Q4G0W2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DUSP28Q4G0W2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DUSP28Q4G0W2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DUSP28Q4G0W2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DUSP28Q4G0W2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
DUSP28Q4G0W2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DUSP28Q4G0W2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DUSP28Q4G0W2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DUSP28Q4G0W2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DUSP28Q4G0W2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
DUSP28Q4G0W2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DUSP28Q4G0W2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DUSP28Q4G0W2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DUSP28Q4G0W2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DUSP28Q4G0W2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DUSP28Q4G0W2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DUSP28Q4G0W2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DUSP28Q4G0W2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DUSP28Q4G0W2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
DUSP28Q4G0W2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DUSP28Q4G0W2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DUSP28Q4G0W2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DUSP28Q4G0W2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DUSP28Q4G0W2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DUSP28Q4G0W2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DUSP28Q4G0W2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DUSP28Q4G0W2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DUSP28Q4G0W2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DUSP28Q4G0W2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DUSP28Q4G0W2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DUSP28Q4G0W2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DUSP28Q4G0W2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DUSP28Q4G0W2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DUSP28Q4G0W2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DUSP28Q4G0W2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DUSP28Q4G0W2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DUSP28Q4G0W2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DUSP28Q4G0W2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DUSP28Q4G0W2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DUSP28Q4G0W2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DUSP28Q4G0W2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DUSP28Q4G0W2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
DUSP28Q4G0W2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DUSP28Q4G0W2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DUSP28Q4G0W2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DUSP28Q4G0W2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
DUSP28Q4G0W2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DUSP28Q4G0W2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DUSP28Q4G0W2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DUSP28Q4G0W2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DUSP28Q4G0W2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DUSP28Q4G0W2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DUSP28Q4G0W2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DUSP28Q4G0W2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
DUSP28Q4G0W2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DUSP28Q4G0W2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DUSP28Q4G0W2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DUSP28Q4G0W2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DUSP28Q4G0W2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DUSP28Q4G0W2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
DUSP28Q4G0W2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DUSP28Q4G0W2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DUSP28Q4G0W2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DUSP28Q4G0W2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DUSP28Q4G0W2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DUSP28Q4G0W2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
DUSP28Q4G0W2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DUSP28Q4G0W2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DUSP28Q4G0W2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DUSP28Q4G0W2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DUSP28Q4G0W2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DUSP28Q4G0W2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DUSP28Q4G0W2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DUSP28Q4G0W2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
DUSP28Q4G0W2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DUSP28Q4G0W2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DUSP28Q4G0W2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DUSP28Q4G0W2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DUSP28Q4G0W2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
DUSP28Q4G0W2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
DUSP28Q4G0W2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
DUSP28Q4G0W2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DUSP28Q4G0W2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
DUSP28Q4G0W2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DUSP28Q4G0W2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DUSP28Q4G0W2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms