Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SP6Q3SY56 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SP6Q3SY56 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SP6Q3SY56 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SP6Q3SY56 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SP6Q3SY56 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SP6Q3SY56 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SP6Q3SY56 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SP6Q3SY56 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SP6Q3SY56 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SP6Q3SY56 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SP6Q3SY56 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SP6Q3SY56 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SP6Q3SY56 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SP6Q3SY56 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SP6Q3SY56 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SP6Q3SY56 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SP6Q3SY56 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SP6Q3SY56 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SP6Q3SY56 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SP6Q3SY56 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SP6Q3SY56 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SP6Q3SY56 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SP6Q3SY56 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SP6Q3SY56 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SP6Q3SY56 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SP6Q3SY56 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SP6Q3SY56 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SP6Q3SY56 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SP6Q3SY56 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SP6Q3SY56 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SP6Q3SY56 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SP6Q3SY56 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SP6Q3SY56 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SP6Q3SY56 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SP6Q3SY56 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SP6Q3SY56 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SP6Q3SY56 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SP6Q3SY56 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SP6Q3SY56 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SP6Q3SY56 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SP6Q3SY56 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SP6Q3SY56 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SP6Q3SY56 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SP6Q3SY56 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SP6Q3SY56 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SP6Q3SY56 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SP6Q3SY56 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SP6Q3SY56 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SP6Q3SY56 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SP6Q3SY56 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SP6Q3SY56 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SP6Q3SY56 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SP6Q3SY56 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SP6Q3SY56 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SP6Q3SY56 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SP6Q3SY56 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SP6Q3SY56 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SP6Q3SY56 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SP6Q3SY56 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SP6Q3SY56 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SP6Q3SY56 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SP6Q3SY56 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SP6Q3SY56 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SP6Q3SY56 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SP6Q3SY56 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SP6Q3SY56 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms