Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI59

KRTAP21-2, Keratin-associated protein 21-2, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-2Q3LI59 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP21-2Q3LI59 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms