Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NBPF8Q3BBV2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NBPF8Q3BBV2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NBPF8Q3BBV2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NBPF8Q3BBV2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NBPF8Q3BBV2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NBPF8Q3BBV2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
NBPF8Q3BBV2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
NBPF8Q3BBV2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
NBPF8Q3BBV2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
NBPF8Q3BBV2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NBPF8Q3BBV2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NBPF8Q3BBV2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NBPF8Q3BBV2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NBPF8Q3BBV2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NBPF8Q3BBV2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
NBPF8Q3BBV2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NBPF8Q3BBV2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NBPF8Q3BBV2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NBPF8Q3BBV2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NBPF8Q3BBV2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NBPF8Q3BBV2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NBPF8Q3BBV2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NBPF8Q3BBV2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
NBPF8Q3BBV2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NBPF8Q3BBV2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NBPF8Q3BBV2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NBPF8Q3BBV2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NBPF8Q3BBV2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC33.22■■■□□ 2.91
NBPF8Q3BBV2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
NBPF8Q3BBV2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NBPF8Q3BBV2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NBPF8Q3BBV2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NBPF8Q3BBV2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NBPF8Q3BBV2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NBPF8Q3BBV2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NBPF8Q3BBV2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
NBPF8Q3BBV2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC33.2■■■□□ 2.91
NBPF8Q3BBV2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NBPF8Q3BBV2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
NBPF8Q3BBV2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NBPF8Q3BBV2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
NBPF8Q3BBV2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NBPF8Q3BBV2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NBPF8Q3BBV2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NBPF8Q3BBV2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NBPF8Q3BBV2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NBPF8Q3BBV2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NBPF8Q3BBV2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NBPF8Q3BBV2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NBPF8Q3BBV2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NBPF8Q3BBV2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NBPF8Q3BBV2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NBPF8Q3BBV2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NBPF8Q3BBV2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NBPF8Q3BBV2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
NBPF8Q3BBV2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NBPF8Q3BBV2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NBPF8Q3BBV2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NBPF8Q3BBV2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NBPF8Q3BBV2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NBPF8Q3BBV2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
NBPF8Q3BBV2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NBPF8Q3BBV2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NBPF8Q3BBV2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NBPF8Q3BBV2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NBPF8Q3BBV2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NBPF8Q3BBV2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NBPF8Q3BBV2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NBPF8Q3BBV2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NBPF8Q3BBV2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
NBPF8Q3BBV2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
NBPF8Q3BBV2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NBPF8Q3BBV2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
NBPF8Q3BBV2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NBPF8Q3BBV2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NBPF8Q3BBV2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NBPF8Q3BBV2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.89
NBPF8Q3BBV2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
NBPF8Q3BBV2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NBPF8Q3BBV2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NBPF8Q3BBV2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NBPF8Q3BBV2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NBPF8Q3BBV2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NBPF8Q3BBV2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NBPF8Q3BBV2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
NBPF8Q3BBV2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NBPF8Q3BBV2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
NBPF8Q3BBV2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
NBPF8Q3BBV2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NBPF8Q3BBV2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NBPF8Q3BBV2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NBPF8Q3BBV2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NBPF8Q3BBV2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NBPF8Q3BBV2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NBPF8Q3BBV2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NBPF8Q3BBV2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NBPF8Q3BBV2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NBPF8Q3BBV2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NBPF8Q3BBV2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms