Protein–RNA interactions for Protein: Q330K2

NDUFAF6, NADH dehydrogenase (ubiquinone) complex I, assembly factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF6Q330K2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFAF6Q330K2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFAF6Q330K2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFAF6Q330K2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFAF6Q330K2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDUFAF6Q330K2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDUFAF6Q330K2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDUFAF6Q330K2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDUFAF6Q330K2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDUFAF6Q330K2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDUFAF6Q330K2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFAF6Q330K2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFAF6Q330K2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFAF6Q330K2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFAF6Q330K2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFAF6Q330K2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFAF6Q330K2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFAF6Q330K2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFAF6Q330K2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFAF6Q330K2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFAF6Q330K2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDUFAF6Q330K2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFAF6Q330K2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFAF6Q330K2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFAF6Q330K2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFAF6Q330K2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFAF6Q330K2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFAF6Q330K2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFAF6Q330K2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDUFAF6Q330K2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NDUFAF6Q330K2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NDUFAF6Q330K2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NDUFAF6Q330K2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDUFAF6Q330K2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDUFAF6Q330K2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFAF6Q330K2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFAF6Q330K2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFAF6Q330K2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFAF6Q330K2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFAF6Q330K2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFAF6Q330K2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFAF6Q330K2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFAF6Q330K2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFAF6Q330K2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFAF6Q330K2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFAF6Q330K2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFAF6Q330K2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFAF6Q330K2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFAF6Q330K2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFAF6Q330K2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFAF6Q330K2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFAF6Q330K2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFAF6Q330K2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFAF6Q330K2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFAF6Q330K2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFAF6Q330K2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFAF6Q330K2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFAF6Q330K2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFAF6Q330K2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFAF6Q330K2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFAF6Q330K2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFAF6Q330K2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFAF6Q330K2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFAF6Q330K2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFAF6Q330K2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFAF6Q330K2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFAF6Q330K2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFAF6Q330K2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFAF6Q330K2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFAF6Q330K2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFAF6Q330K2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFAF6Q330K2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFAF6Q330K2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFAF6Q330K2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFAF6Q330K2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFAF6Q330K2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFAF6Q330K2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDUFAF6Q330K2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDUFAF6Q330K2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDUFAF6Q330K2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDUFAF6Q330K2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDUFAF6Q330K2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDUFAF6Q330K2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDUFAF6Q330K2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDUFAF6Q330K2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFAF6Q330K2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFAF6Q330K2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFAF6Q330K2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFAF6Q330K2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFAF6Q330K2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFAF6Q330K2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDUFAF6Q330K2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDUFAF6Q330K2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NDUFAF6Q330K2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NDUFAF6Q330K2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NDUFAF6Q330K2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NDUFAF6Q330K2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NDUFAF6Q330K2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDUFAF6Q330K2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDUFAF6Q330K2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms