Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HFEQ30201 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HFEQ30201 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HFEQ30201 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HFEQ30201 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HFEQ30201 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
HFEQ30201 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HFEQ30201 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HFEQ30201 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HFEQ30201 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HFEQ30201 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HFEQ30201 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HFEQ30201 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HFEQ30201 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HFEQ30201 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HFEQ30201 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HFEQ30201 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HFEQ30201 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HFEQ30201 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HFEQ30201 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HFEQ30201 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HFEQ30201 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HFEQ30201 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HFEQ30201 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HFEQ30201 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HFEQ30201 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HFEQ30201 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HFEQ30201 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HFEQ30201 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HFEQ30201 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HFEQ30201 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HFEQ30201 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HFEQ30201 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HFEQ30201 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HFEQ30201 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HFEQ30201 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HFEQ30201 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HFEQ30201 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HFEQ30201 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HFEQ30201 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HFEQ30201 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HFEQ30201 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HFEQ30201 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HFEQ30201 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
HFEQ30201 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HFEQ30201 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HFEQ30201 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HFEQ30201 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HFEQ30201 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HFEQ30201 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HFEQ30201 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HFEQ30201 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HFEQ30201 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HFEQ30201 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HFEQ30201 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HFEQ30201 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HFEQ30201 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HFEQ30201 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HFEQ30201 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
HFEQ30201 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HFEQ30201 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HFEQ30201 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HFEQ30201 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HFEQ30201 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HFEQ30201 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HFEQ30201 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HFEQ30201 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
HFEQ30201 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
HFEQ30201 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HFEQ30201 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HFEQ30201 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
HFEQ30201 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HFEQ30201 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HFEQ30201 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HFEQ30201 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HFEQ30201 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
HFEQ30201 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HFEQ30201 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HFEQ30201 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HFEQ30201 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HFEQ30201 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HFEQ30201 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HFEQ30201 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HFEQ30201 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
HFEQ30201 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HFEQ30201 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HFEQ30201 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HFEQ30201 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HFEQ30201 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HFEQ30201 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HFEQ30201 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HFEQ30201 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HFEQ30201 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HFEQ30201 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HFEQ30201 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HFEQ30201 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HFEQ30201 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HFEQ30201 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HFEQ30201 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HFEQ30201 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms